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2008 年度 実績報告書

核膜形成機構の1分子解析

研究課題

研究課題/領域番号 20870022
研究機関京都大学

研究代表者

平野 泰弘  京都大学, 生命科学研究科, 特定研究員 (10508641)

キーワードLEMタンパク質 / 核膜 / NMR / リン酸化 / BAF
研究概要

核膜再構成の第1段階である核膜小胞のターゲッティングには、核膜内膜に特異的に局在するLEMタンパク質(emerin、MAN1、LAPなど)とその結合タンパク質BAFの相互作用が重要であること、これらの複合体が"コア"と呼ばれる染色体上の特異的な構造を作ることが知られている。申請者のこれまでの研究から、LEMタンパク質とBAFの結合は、BAF結合領域であるLEMドメインから1次配列上非常に離れた"調節部位"で制御されていることが明らかになり、この調節部位のリン酸化がタンパク質全体の3次構造の変化を引き起こすことが示唆されていた。そこで本研究では、(I)LEMタンパク質の立体構造解析、(II)コア領域が形成される染色体部位の同定、(III)LEMタンパク質-BAF-染色体複合体の安定化メカニズムの解明を行う。これらのうち、本年度は(I)、(II)の項目について、以下に示す研究を実施した。
(I)LEMタンパク質の立体構造解析
LEMタンパク質emerinのリン酸化状態の立体構造を、核磁気共鳴(NMR)を用いて決定することを試みた。小麦胚芽を用いた無細胞タンパク質合成系を用いて、NMR測定に必要な精製度のemerinの作成を行ったが、この合成系においてemerinは不溶化してしまい、精製が困難であった。現在は、精製に使用するタグを替えるなど、精製条件の検討を行っている。
(II)コア領域が形成される染色体部位の同定
DNA adenine methyltransferase identification (DamID)法を用いてコア領域が形成される染色体部位を同定することを試みた。このためにDam融合BAFを作成した。本実験では細胞周期を正確に調節した均一な細胞集団を得ることが必須であるため、BAF-Damを安定に発現する安定発現細胞株の作成を試みたが、現在のところ細胞株は得られていない。今後、細胞種の変更を含め検討する必要がある。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2009 2008

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Cell cycle-dependent phosphorylation of MAN12009

    • 著者名/発表者名
      Y. Hirano, Y. Iwase, K. Ishii, M. Kumeta, T. Horigome, K. Takeyasu
    • 雑誌名

      Biochemistry 48

      ページ: 1636-1643

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Proteomic and targeted analytical identification of BXDC1 and EBNA1BP2 as dynamic scaffold proteins in the nucleolus2009

    • 著者名/発表者名
      Y. Hirano, K. Ishii, M. Kumeta, K. Furukawa, K. Takeyasu, T. Horigome
    • 雑誌名

      Genes to Cells 14

      ページ: 155-166

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nuclear matrix contains novel WD-repeat and disordered-region-rich proteins2008

    • 著者名/発表者名
      K. Ishii, Y. Hirano, N. Araki, T. Oda, M. Kumeta, K. Takeyasu, K. Furukawa, T. Horigome
    • 雑誌名

      FEBS letter 582

      ページ: 3515-3519

    • 査読あり
  • [学会発表] Roles of the Tudor Domain of Lamin B Receptor for Chromatin Condensation2008

    • 著者名/発表者名
      Y. Hirano, K. Hizume, Y. Suzuki, H. Takahashi, T. Horigome, K.
    • 学会等名
      Annual meeting of American Society of Cell Biology
    • 発表場所
      San Francisco
    • 年月日
      2008-12-14
  • [学会発表] Functional Characterization of Nuclear Alpha-actinin 42008

    • 著者名/発表者名
      M. Kumeta, Y. Hirano, K., Hashida, S. Yoshimura, K. Takeyasu
    • 学会等名
      Annual meeting of American Society of Cell Biology
    • 発表場所
      San Francisco
    • 年月日
      2008-12-14
  • [学会発表] Structural and Functional Domains of a Nucleolar Protein, N0662008

    • 著者名/発表者名
      Y. Hirai, Y. Hirano, M. Kumeta, K. Takeyasu
    • 学会等名
      Annual meeting of American Society of Cell Biology
    • 発表場所
      San Francisco
    • 年月日
      2008-12-14

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公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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