蛋白質デザインによる自己組織化ナノ繊維形成過程の解明

2009 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 20870043
• 研究種目: 若手研究(スタートアップ)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物物理学
• 研究機関: 大学共同利用機関法人自然科学研究機構(岡崎共通研究施設)
• 研究代表者: 真壁 幸樹 大学共同利用機関法人自然科学研究機構(岡崎共通研究施設), 岡崎統合バイオサイエンスセンター, 助教 (20508072)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2009
• キーワード: 蛋白質デザイン / βシート / アミロイド / フォールディング / 生物物理

研究概要

βシート研究のモデル蛋白質OspAを用いて変異体のX線結晶構造解析に成功した。また、フォールディング反応の研究から経路上の中間体を経るまきもどり過程であることを見いだした。

研究成果

• [雑誌論文] Minimalist design of water-soluble cross-beta architecture. (2010)
  • 著者名/発表者名: Biancalana M, Makabe K, Koide S.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A. 107 ページ: 3469-3474
  • 査読あり
• [雑誌論文] Different Folding Pathways Taken by Highly Homologous Proteins, Goat alpha-Lactalbumin and Canine Milk Lysozyme. (2010)
  • 著者名/発表者名: Nakamura T, Makabe K, Tomoyori K, Maki K, Mukaiyama A, Kuwajima K.
  • 雑誌名: J Mol Biol. 396 ページ: 1361-1378
  • 査読あり
• [雑誌論文] Flexible recognition of the tRNA G18 methylation target site by TrmH methyltransferase through first binding and induced fit processes. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ochi A, Makabe K, Kuwajima K, Hori H.
  • 雑誌名: J Biol Chem. 285 ページ: 9018-9029
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural Basis for Exquisite Specificity of Affinity Clamps, Synthetic Binding Proteins Generated through Directed Domain-interface Evolution. (2009)
  • 著者名/発表者名: Huang J, Makabe K, Biancalana M, Koide A, Koide S.
  • 雑誌名: J Mol Biol. 392 ページ: 1221-1231
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular Mechanism of Thioflavin-T Binding to the Surface of beta-Rich Peptide Self-Assemblies. (2009)
  • 著者名/発表者名: Biancalana M, Makabe K, Koide A, Koide S.
  • 雑誌名: J Mol Biol. 385 ページ: 1052-1063
  • 査読あり
• [雑誌論文] The promiscuity of beta-strand pairing allows for rational design of beta-sheet face inversion. (2008)
  • 著者名/発表者名: Makabe K, Koide S.
  • 雑誌名: J Am Chem Soc. 130 ページ: 14370-14371
  • 査読あり
• [学会発表] βシート蛋白質の構造形成機構 (2010)
  • 著者名/発表者名: 真壁幸樹, 小出昌平, 桑島邦博
  • 学会等名: 生物物理学会中部支部講演会
  • 年月日: 20100000
• [学会発表] -シート形成における主鎖水素結合の役割 (2009)
  • 著者名/発表者名: 真壁幸樹, 小出昌平, 桑島邦博
  • 学会等名: 蛋白質科学会
  • 発表場所: 熊本
  • 年月日: 20090000
• [学会発表] Protein design approach for β-sheet characterization (2009)
  • 著者名/発表者名: Koki Makabe
  • 学会等名: 北海道大学-Mahidol大学若手合同シンポジウム
  • 年月日: 20090000
• [学会発表] Structures of β-Sheet Self-Assembly Mimics (2009)
  • 著者名/発表者名: Koki Makabe, Shohei Koide, Kunihiro Kuwajima
  • 学会等名: Asia Core
  • 発表場所: 韓国, ソウル
  • 年月日: 20090000
• [備考] 桑島研究室ホームページ
  • URL: http://gagliano.ims.ac.jp/