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2020 年度 実績報告書

複雑骨格天然物生合成酵素の精密構造機能解析に基づく合成生物学と創薬

研究課題

研究課題/領域番号 20H00490
研究機関東京大学

研究代表者

阿部 郁朗  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 教授 (40305496)

研究分担者 淡川 孝義  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 准教授 (80609834)
森 貴裕  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 助教 (60734564)
牛丸 理一郎  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 助教 (10873648)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
キーワード合成生物学 / 生合成工学 / 酵素工学 / 天然物化学
研究実績の概要

複雑骨格天然物の新奇な生合成マシナリーの詳細とその立体構造基盤の解明と創薬を目的とした。本研究では、人為的な機能制御と分子多様性創出の格好のモデルともいえる、強力なタンパクリン酸化酵素活性化作用を示すテレオシジンなど、テルペンインドール・アルカロイドとその関連化合物をとりあげた。有機化学を基盤として、その生合成マシナリーの詳細を酵素・遺伝子レベルで明らかにするとともに、酵素反応機構とその立体構造基盤を解明した。また、酵素タンパクの立体構造情報に基づく合理的な触媒機能の改変により、さらなる分子多様性と新規骨格の創出をめざした。本研究により合成生物学と創薬研究の革新的ツールとなる超天然型新規生体触媒と創薬シード化合物の創製を実現をめざした。2020年度は、テレオシジン骨格構築に科川rP450酵素に、合成基質アナログを用いた酵素反応とX線結晶構造解析により、本酵素が触媒する9員環ラクタム形成の反応機構を解明し、さらにメカニズムを基盤とした基質デザインにより、新規indolactam類縁体とこれまでにない6/5/8縮環構造を有する新規化合物の創出を達成した。また、関連する非リボソームペプチド、テルペノイド、メロテルペノイドなどの新規生合成マシナリーを見出し、その機能解明、生合成改変などに成功、質量ともに充実した研究成果を挙げることに成功した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

新型コロナウイルス感染症拡大に伴い、予定していたポスドクの来日が遅れ、国内外の学会、研究打ち合わせのキャンセルなどのため当初遅れがあったが、一方で、質量ともに充実した研究成果を挙げることに成功した。内外との共同研究者とも着実に多くの優れた論文として結実した。

今後の研究の推進方策

2022年度は最終年度。引き続き、関連する複雑国家ウ天然物を取り上げ、その生合成マシナリーの詳細を酵素・遺伝子レベルで明らかにするとともに、酵素反応機構とその立体構造基盤を解明する。また、酵素タンパクの立体構造情報に基づく合理的な触媒機能の改変により、さらなる分子多様性と新規骨格の創出する。本研究により合成生物学と創薬研究の革新的ツールとなる超天然型新規生体触媒と創薬シード化合物の創製を実現をめざす。3年間の研究成果を取りまとめる。

  • 研究成果

    (20件)

すべて 2020 その他

すべて 国際共同研究 (4件) 雑誌論文 (14件) (うち国際共著 9件、 査読あり 14件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (1件) (うち招待講演 1件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] ボストン大学/カリフォルニア大学/スクリプス研究所(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      ボストン大学/カリフォルニア大学/スクリプス研究所
    • 他の機関数
      5
  • [国際共同研究] ボン大学/チュービンゲン大学(ドイツ)

    • 国名
      ドイツ
    • 外国機関名
      ボン大学/チュービンゲン大学
  • [国際共同研究] 中国科学院/武漢大学/浙江大学(中国)

    • 国名
      中国
    • 外国機関名
      中国科学院/武漢大学/浙江大学
    • 他の機関数
      5
  • [国際共同研究] チェコ科学アカデミー(チェコ)

    • 国名
      チェコ
    • 外国機関名
      チェコ科学アカデミー
  • [雑誌論文] Exploiting a C-N Bond Forming Cytochrome-P450 Monooxygenase for C-S Bond Formation2020

    • 著者名/発表者名
      Morita Iori、Mori Takahiro、Mitsuhashi Takaaki、Hoshino Shotaro、Taniguchi Yoshimasa、Kikuchi Takashi、Nagae Kei、Nasu Norihiro、Fujita Makoto、Ohwada Tomohiko、Abe Ikuro
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition

      巻: 59 ページ: 3988~3993

    • DOI

      10.1002/anie.201916269

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Exploiting the Potential of Meroterpenoid Cyclases to Expand the Chemical Space of Fungal Meroterpenoids2020

    • 著者名/発表者名
      Mitsuhashi Takaaki、Barra Lena、Powers Zachary、Kojasoy Volga、Cheng Andrea、Yang Feng、Taniguchi Yoshimasa、Kikuchi Takashi、Fujita Makoto、Tantillo Dean J.、Porco John A.、Abe Ikuro
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition

      巻: 59 ページ: 23772~23781

    • DOI

      10.1002/anie.202011171

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Heterochiral coupling in non-ribosomal peptide macrolactamization2020

    • 著者名/発表者名
      Matsuda Kenichi、Zhai Rui、Mori Takahiro、Kobayashi Masakazu、Sano Ayae、Abe Ikuro、Wakimoto Toshiyuki
    • 雑誌名

      Nature Catalysis

      巻: 3 ページ: 507~515

    • DOI

      10.1038/s41929-020-0456-7

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Acyltransferase that catalyses the condensation of polyketide and peptide moieties of goadvionin hybrid lipopeptides2020

    • 著者名/発表者名
      Kozakai Ryosuke、Ono Takuto、Hoshino Shotaro、Takahashi Hidenori、Katsuyama Yohei、Sugai Yoshinori、Ozaki Taro、Teramoto Kazuya、Teramoto Kanae、Tanaka Koichi、Abe Ikuro、Asamizu Shumpei、Onaka Hiroyasu
    • 雑誌名

      Nature Chemistry

      巻: 12 ページ: 869~877

    • DOI

      10.1038/s41557-020-0508-2

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Biosynthesis of Biscognienyne?B Involving a Cytochrome P450‐Dependent Alkynylation2020

    • 著者名/発表者名
      Lv Jian‐Ming、Gao Yao‐Hui、Zhao Huan、Awakawa Takayoshi、Liu Ling、Chen Guo‐Dong、Yao Xin‐Sheng、Hu Dan、Abe Ikuro、Gao Hao
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition

      巻: 59 ページ: 13531~13536

    • DOI

      10.1002/anie.202004364

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Discovery of the cryptic function of terpene cyclases as aromatic prenyltransferases2020

    • 著者名/発表者名
      He Haibing、Bian Guangkai、Herbst-Gervasoni Corey J.、Mori Takahiro、Shinsky Stephen A.、Hou Anwei、Mu Xin、Huang Minjian、Cheng Shu、Deng Zixin、Christianson David W.、Abe Ikuro、Liu Tiangang
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 ページ: 3958

    • DOI

      10.1038/s41467-020-17642-2

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Identification and characterization of N9-methyltransferase involved in converting caffeine into non-stimulatory theacrine in tea2020

    • 著者名/発表者名
      Zhang Yue-Hong、Li Yi-Fang、Wang Yongjin、Tan Li、Cao Zhi-Qin、Xie Chao、Xie Guo、Gong Hai-Biao、Sun Wan-Yang、Ouyang Shu-Hua、Duan Wen-Jun、Lu Xiaoyun、Ding Ke、Kurihara Hiroshi、Hu Dan、Zhang Zhi-Min、Abe Ikuro、He Rong-Rong
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 ページ: 1473

    • DOI

      10.1038/s41467-020-15324-7

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Structural Diversification of Andiconin-Derived Natural Products by α-Ketoglutarate-Dependent Dioxygenases2020

    • 著者名/発表者名
      Bai Tongxuan、Matsuda Yudai、Tao Hui、Mori Takahiro、Zhang Yonghui、Abe Ikuro
    • 雑誌名

      Organic Letters

      巻: 22 ページ: 4311~4315

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.0c01358

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Sporormielones A-E, bioactive novel C-C coupled orsellinic acid derivative dimers, and their biosynthetic origin2020

    • 著者名/発表者名
      Chen Guo-Dong、Hu Dan、Huang Mei-Juan、Tang Jia、Wang Xiao-Xia、Zou Jian、Xie Jun、Zhang Wei-Guang、Guo Liang-Dong、Yao Xin-Sheng、Abe Ikuro、Gao Hao
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 56 ページ: 4607~4610

    • DOI

      10.1039/D0CC00855A

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Deciphering the Biosynthetic Mechanism of Pelletierine in Lycopodium Alkaloid Biosynthesis2020

    • 著者名/発表者名
      Wang Juan、Zhang Ze-Kun、Jiang Fang-Fang、Qi Bo-Wen、Ding Ning、Hnin Saw Yu Yu、Liu Xiao、Li Jun、Wang Xiao-hui、Tu Peng-Fei、Abe Ikuro、Morita Hiroyuki、Shi She-Po
    • 雑誌名

      Organic Letters

      巻: 22 ページ: 8725~8729

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.0c03339

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Total Synthesis and Structural Revision of Kasumigamide, and Identification of a New Analogue2020

    • 著者名/発表者名
      Kuranaga Takefumi、Matsuda Kenichi、Takaoka Masachika、Tachikawa Chisato、Sano Ayae、Itoh Kosei、Enomoto Ayumu、Fujita Kei、Abe Ikuro、Wakimoto Toshiyuki
    • 雑誌名

      ChemBioChem

      巻: 21 ページ: 3329~3332

    • DOI

      10.1002/cbic.202000409

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular Basis for Sesterterpene Diversity Produced by Plant Terpene Synthases2020

    • 著者名/発表者名
      Chen Qingwen、Li Jianxu、Liu Zhixi、Mitsuhashi Takaaki、Zhang Yuting、Liu Haili、Ma Yihua、He Juan、Shinada Tetsuro、Sato Tsutomu、Wang Yong、Liu Hongwei、Abe Ikuro、Zhang Peng、Wang Guodong
    • 雑誌名

      Plant Communications

      巻: 1 ページ: 100051~100051

    • DOI

      10.1016/j.xplc.2020.100051

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Fungal Meroterpenoids2020

    • 著者名/発表者名
      Matsuda Yudai、Abe Ikuro
    • 雑誌名

      Comprehensive Natural Products III: Chemistry and Biology

      巻: 1 ページ: 445~478

    • DOI

      10.1016/B978-0-12-409547-2.14663-3

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Sesterterpenoids2020

    • 著者名/発表者名
      Mitsuhashi Takaaki、Abe Ikuro
    • 雑誌名

      Progress in the Chemistry of Organic Natural Products,

      巻: 111 ページ: 1~79

    • DOI

      10.1007/978-3-030-37865-3_1

    • 査読あり
  • [学会発表] 非ヘム鉄-αケトグルタル酸依存性酸化酵素に関する研究2020

    • 著者名/発表者名
      阿部郁朗
    • 学会等名
      第22回 生体触媒シンポジウム
    • 招待講演
  • [備考] 東京大学大学院薬学系研究科天然物化学教室

    • URL

      https://tennen.f.u-tokyo.ac.jp/head.htm

URL: 

公開日: 2022-12-28  

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