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2022 年度 実績報告書

時空間分子プログラミングの新展開

研究課題

研究課題/領域番号 20H00618
研究機関東北大学

研究代表者

村田 智  東北大学, 工学研究科, 教授 (10334533)

研究分担者 川又 生吹  東北大学, 工学研究科, 助教 (30733977)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2025-03-31
キーワード時空間分子プログラミング / DNAコンピューティング / 反応拡散系
研究実績の概要

本研究では,(1)時空間分子プログラミングに適した反応系の設計,(2)形成したパターンの物質化,(3)シミュレーションモデルの構築の3つを研究目的としている.(1)の時空間プログラミングに適した反応系の設計については,これまでの研究でゲル中のDNA分子反応に基づくカスケードパターン形成の理論的および実験的方法論を確立した.(2)の形成したパターンの物質化については,媒質をゲルからゾルに拡張し,パターンが形成された場所に特異的な性質(粘性,拡散係数など)の制御をねらっている.前年度に発見したパターン形成後にパターンの位置が動的に変化する現象について繰り返し実験を行い,再現性を確認した.また,反応槽の大きさや形状,反応温度,DNAモチーフの濃度などを様々に変化させた実験も行い,動的パターンの発生と消滅がどのような条件下で起こるかプロセスの解明を進めた.(3)のシミュレーションモデルの構築については,(2)の実験結果を説明するモデルを検討した結果,従来の反応拡散モデルの単なる拡張では記述が難しいという感触を得ている.今後は移流反応拡散モデルを含めて新たな枠組みを検討する必要がある.

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

ゾル媒体における反応拡散系で,動的なパターン形成という新規な現象を発見し,その機序の解明を進めているがまだ定性的な理解にとどまっている.これが定量的にモデル化できれば,時空間パターン形成研究の新しい展開が期待できる.

今後の研究の推進方策

引き続き高粘度のアクリルアミドゾルを媒質として,動的パターンの発生と消滅のプロセスの原理の解明を進める.特に,モチーフの分子設計そのものの変更を含めて検討する.動的パターン形成のモデル化のために移流反応拡散系の構築を試みる.

備考

分子ロボティクス研究室ウェブサイト/研究成果/反応拡散によるパターン形成
http://www.molbot.mech.tohoku.ac.jp/achievements/

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2022

すべて 学会発表 (2件) 図書 (1件)

  • [学会発表] 分岐したDNAモチーフを用いたゾル媒体中でのパターン形成2022

    • 著者名/発表者名
      緒方寛,安部桂太,川又生吹,村田智
    • 学会等名
      第6回分子ロボティクス年次大会
  • [学会発表] Pattern formation in sol media using branched DNA motifs2022

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Ogata, Keita Abe, Ibuki Kawamata, Satoshi Murata
    • 学会等名
      CBI学会2022年大会
  • [図書] Molecular Robotics -An Introduction2022

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Murata (Editor)
    • 総ページ数
      296
    • 出版者
      Springer
    • ISBN
      978-981-19-3986-0

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公開日: 2023-12-25  

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