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Non coding RNA (ncRNA)は多数の類似した高次構造を形成するため、これらを標的としたRNA結合性小分子の報告例は限られている。本研究ではRNA標的創薬を指向し、多様なRNA高次構造に対して化学反応性を持つ分子の真の選択性解析法の確立及びそれを用いた新しい構造反応性相関研究への展開、さらにはこれらの結果得られた高い選択性を持つRNA高次構造反応性分子を用いた細胞内標的の効率的阻害を目的とした。本解析法を確立することで、まず特定の化学反応性分子に関する大規模な反応特性情報（反応するRNA高次構造のランク化による選択性情報）が得られる。さらにこの解析法を用いて、反応性分子ごとの高次構造RNAに対する大規模な構造反応性相関情報を明らかにできる。具体的には、RNA小分子間相互作用大規模解析を可能とする方法を基本に、反応性分子のRNA高次構造に対する選択性を大規模に解析する手法を確立する。本年度はアルキル化分子の多様性拡大を目指し下記の2点について検討した。
様々なRNA高次構造結合分子を持つVQ誘導体の合成：本年度は、昨年度開発に成功した新たなVQ誘導体を用いて、RNA結合部位としてベルベリン誘導体と複合した分子を合成し、アルキル化するRNA配列情報の取得について検討した。その結果、アクリジンを導入したVQ誘導体とは異なるアルキル化するRNA配列情報が得られた。
より効率的に機能するOFF-ON型反応性分子の開発：本年度は反応分子の拡張を目指し、新たなOFF-ON型反応性分子として、VQ誘導体よりもコンパクトな分子である、ピリミジン骨格を基本とする反応性分子を合成した。合成した反応性分子を用いて、検討を行ったところ、G４構造を持つDNAに対して効率的に反応することを見出した。
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