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2020 年度 実績報告書

超高速一細胞代謝フェノタイピング技術の創生

研究課題

研究課題/領域番号 20H02872
研究機関国立研究開発法人産業技術総合研究所

研究代表者

三浦 大典  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 主任研究員 (40532627)

研究分担者 藤村 由紀  九州大学, 農学研究院, 准教授 (20390304)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
キーワードMALDI-MS / singles cell / フェノタイピング / 代謝
研究実績の概要

本申請では、細胞単位での“物質的フェノタイプ”とも言われるメタボロームをプロファイルとして捉え、各々の“細胞の個性”を高解像度に捉える超高速・高 感度分析法を開発し、疾患や薬剤投与などへの応答をフェノタイプとして捉える事を目標としている。MALDI-MS では液滴でマトリックスを供給するドロップレット法、エアブラシなどで供給するスプレー法、昇華により供給する蒸着法があり、最も微細なサンプル調製が可 能なのは蒸着法であるが、一般的に感度が非常に低くなり、マトリクスの均一性と分析感度はトレードオフの関係にある。蒸着法でマトリックスを供給した場合には単一細胞レベルの均一な表面構造を得ることは可能であるが、極端に感度が落ちることが知られている。そこで、蒸着法でマトリックスを供給した後高感度に分析可能なサンプル調製法の確立を目指し検討を進めた。その結果、蒸着後のサンプルに対してごく穏和な条件で有機溶媒を供給することによって劇的に分析感度が向上することを見出した。

現在までの達成度
現在までの達成度

2: おおむね順調に進展している

理由

本研究を遂行する上で最も重要となるサンプル調製法の最適化に目処が立ったため、順調に進んでいると判断できる。

今後の研究の推進方策

当初予定していなかったが、検討用に用いていたW/Oドロップレットが想定よりも汎用性の高いものであったことから、今後はこれを用いた用いたハイスループッ トスクリーニング系の構築にも挑戦したい。

  • 研究成果

    (1件)

すべて 2021

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件)

  • [雑誌論文] Validation and standardization of DNA extraction and library construction methods for metagenomics-based human fecal microbiome measurements2021

    • 著者名/発表者名
      Dieter M Tourlousse, Koji Narita, Takamasa Miura, Mitsuo Sakamoto, Akiko Ohashi, Keita Shiina, Masami Matsuda, Daisuke Miura et al.
    • 雑誌名

      Microbiome

      巻: 9 ページ: 1-19

    • DOI

      10.1186/s40168-021-01048-3

    • 査読あり

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公開日: 2022-12-28  

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