• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2022 年度 実績報告書

腸内細菌叢内のビフィズス菌の遺伝子発現プロファイルの解明:選択的な回収方法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 20H02893
研究機関北海道大学

研究代表者

吹谷 智  北海道大学, 農学研究院, 教授 (10370157)

研究分担者 後藤 恭宏  九州大学, 医学研究院, 助教 (20558358)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
キーワードビフィズス菌 / トランスクリプトーム / 腸内細菌叢 / RNA-Seq / 選択的回収
研究実績の概要

・Strep-tagIIタグ発現株を用いた人工腸内細菌叢からの回収方法の検討
昨年度までの評価で最も効率よくBifidobacterium longum 105-A株を回収できることが明らかになったStrep-tagIIタグ発現株について,複数の代表的な腸内細菌種からなる人工腸内細菌叢からの回収を検討した.タグ発現株およびヒト腸内細菌叢の優占種である7種の細菌種(Bacteroidetes門3種,Firmicutes門2種,Actinobacteria門2種)をそれぞれ培養し,同一ODとなるように混合して人工腸内細菌叢を作成した.ここからStrep-tactin結合ビーズを用いてタグ発現株の回収を行った.B. longum特異的プローブを用いてFISH法によりタグ発現株を検出し,回収前後のタグ発現株の菌数を比較して回収率を評価した.その結果,25%の回収率,90%以上の純度でタグ発現株を回収できたことから,他の腸内細菌存在下でもタグ発現105-A株の回収が可能であることが明らかになった.
上記の結果の再現性を検証する段階で,タグ発現株が回収できなくなるという問題が発生した.タグ融合タンパク質の細胞内での発現は確認できたこと,105-A株は細胞表層に多糖の層を形成することから,細胞表層へのタグの提示の問題または提示されたタグが多糖の層に埋もれ,磁気ビーズとの結合が妨げられていることが原因と推察された.この問題を回避するため,表層提示に用いたタンパク質GltAとタグの間にさらに他のタンパク質を融合させた組換えタンパク質を発現するプラスミドを構築し,多糖の層を越えてタグを表層提示できる菌株を構築することにより,安定した選択的な回収方法の確立を進めている.

現在までの達成度 (段落)

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2023 2022

すべて 学会発表 (4件)

  • [学会発表] Bifidobacterium longum subsp. longum における1-Kestose 代謝メカニズムの解明2023

    • 著者名/発表者名
      難波 有希、倉持 碧海、山口 颯人、吉田 佳鼓、後藤 恭宏、門田 吉弘、栃尾 巧、小椋 義俊、林 哲也、前田 智也、横田 篤、吹谷 智
    • 学会等名
      日本農芸化学会2023年度大会
  • [学会発表] 腸内細菌叢からのビフィズス菌の選択的回収系の確立2022

    • 著者名/発表者名
      宮下 聖也、吉田 佳鼓、嶋田 みな、前田 智也、横田 篤、吹谷 智
    • 学会等名
      日本乳酸菌学会2022年度大会
  • [学会発表] Bifidobacterium longum subsp. longum における1-Kestose 代謝メカニズムの解明2022

    • 著者名/発表者名
      難波 有希、倉持 碧海、山口 颯人、吉田 佳鼓、後藤 恭宏、門田 吉弘、栃尾 巧、小椋 義俊、林 哲也、前田 智也、横田 篤、吹谷 智
    • 学会等名
      日本乳酸菌学会2022年度大会
  • [学会発表] 腸内細菌叢中に存在するビフィズス菌の選択的回収系の確立2022

    • 著者名/発表者名
      宮下聖也,吉田佳鼓,嶋田みな,前田智也,横田篤,吹谷智
    • 学会等名
      令和4年度 日本農芸化学会 北海道・東北支部 合同支部会

URL: 

公開日: 2023-12-25  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi