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2022 年度 実績報告書

実用モデル珪藻の光環境応答・適応機構の最適化

研究課題

研究課題/領域番号 20H03116
研究機関京都大学

研究代表者

伊福 健太郎  京都大学, 農学研究科, 教授 (50359783)

研究分担者 菓子野 康浩  兵庫県立大学, 理学研究科, 准教授 (20221872)
内山 郁夫  基礎生物学研究所, ゲノム情報研究室, 准教授 (90243089)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
キーワード珪藻 / 光合成 / 集光タンパク質 / 環境適応・応答 / 物質生産
研究実績の概要

本研究は、学術的にも産業的にも利用価値があるツノケイソウ(Chaetoceros gracilis)の光環境応答・適応機構を解明し、ゲノム編集等を用いて光合成能力の最適化を目指すものである。今年度は、前年度までに整備し、公表したツノケイソウのゲノム情報データベース、その中に同定された集光性色素タンパク質(FCP)遺伝子群の様々な光環境条件下におけるmRNA発現情報(RNA-Seq)、及び、光化学系-集光性色素タンパク質超複合体の立体構造情報(cryo-EM)を合わせて、潜在的に余剰である可能性のある集光性色素タンパク質(FCP)を選定した。それらの中から、ゲノム編集による遺伝子欠損変異体作成の標的として、光化学系に直接結合するFCPから2分子種、クライオ電子顕微鏡構造には認められないが高蓄積するFCPから2分子種、特定の光条件で高発現するFCPから1分子種を選択した。そして標的FCP遺伝子に対してガイドRNAを設計してCas9ヌクレアーゼを発現するツノケイソウに導入した。これまでに3つのFCPに関して遺伝子欠損変異体を複数ライン、作成することに成功した。また、その他の候補についても変異体候補株の単離を行うことができた。すでに得られた3つのFCP欠損変異体については、野生株と大きく異なる光合成特性を有することを認めた。

現在までの達成度 (段落)

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (11件)

すべて 2023 2022 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Structural basis for different types of hetero-tetrameric light-harvesting complexes in a diatom PSII-FCPII supercomplex2022

    • 著者名/発表者名
      Nagao Ryo、Kato Koji、Kumazawa Minoru、Ifuku Kentaro、Yokono Makio、Suzuki Takehiro、Dohmae Naoshi、Akita Fusamichi、Akimoto Seiji、Miyazaki Naoyuki、Shen Jian-Ren
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 13 ページ: 1764

    • DOI

      10.1038/s41467-022-29294-5

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Biodiversity risk assessment of genetically modified <i>Chaetoceros gracilis</i> for outdoor cultivation2022

    • 著者名/発表者名
      Inoue Hidetoshi、Tajima Kumiko、Mitsumori Cristina、Inoue-Kashino Natsuko、Miura Takamasa、Ifuku Kentaro、Hirota Ryuichi、Kashino Yasuhiro、Fujita Katsutoshi、Kinoshita Hiroshi
    • 雑誌名

      The Journal of General and Applied Microbiology

      巻: 68 ページ: 151~162

    • DOI

      10.2323/jgam.2021.11.001

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] ツノケイソウLhcx1遺伝子のゲノム編集を利用した機能破壊と表現型解析2023

    • 著者名/発表者名
      熊沢 穣、石川 規子、辻 祥子、井上(菓子野)名津子、菓子野 康浩、伊福 健太郎
    • 学会等名
      第64回 日本植物生理学会年会 (東北大学川内キャンパス)
  • [学会発表] ツノケイソウの赤色光培養で蓄積する集光性色素タンパク質FCPの同定と機能解析2023

    • 著者名/発表者名
      中村 翠, 熊沢 穣, 長尾 遼, 石川 規子, 沈建仁, 伊福 健太郎
    • 学会等名
      第64回日本植物生理学会年会(東北大学川内キャンパス)
  • [学会発表] ゲノム編集によるツノケイソウ Lhcx1遺伝子の機能破壊と表現型解析2022

    • 著者名/発表者名
      熊沢 穣、石川 規子、辻 祥子、井上(菓子野)名津子、菓子野 康浩、伊福 健太郎
    • 学会等名
      第12回 日本光合成学会年会 (オンライン)
  • [学会発表] Molecular characterization of fucoxanthin-chlorophyll a/c proteins in the diatom Chaetoceros gracilis: the unique diversification process of the light-harvesting complexes in red-algal lineage2022

    • 著者名/発表者名
      Minoru Kumazawa, Hiroyo Nishide, Ryo Nagao, Natsuko Inoue-Kashino, Ikuo Uchiyama, Yasuhiro Kashino, Jian-Ren Shen, Takeshi Nakano, Kentaro Ifuku
    • 学会等名
      International Congress on Photosynthesis Research 2022 (Dunedin, New Zealand)
    • 国際学会
  • [学会発表] Phylogenetic diversity of light harvesting complex proteins in diatoms and other red-lineage algae2022

    • 著者名/発表者名
      Minoru Kumazawa, Hiroyo Nishide, Ryo Nagao, Natsuko Inoue-Kashino, Ikuo Uchiyama, Yasuhiro Kashino, Jian-Ren Shen, Takeshi Nakano, Kentaro Ifuku
    • 学会等名
      International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Regulation (Kobe)
    • 国際学会
  • [学会発表] ツノケイソウの赤色光培養で蓄積するFCP (Fucoxanthin Chlorophyll a/c -Binding Protein)の同定と機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      中村 翠, 熊沢 穣, 長尾 遼, 石川 規子, 沈建仁, 伊福 健太郎
    • 学会等名
      ユーグレナ研究会 第37回研究集会(近畿大学農学部)
  • [学会発表] ツノケイソウの赤色光応答に関する解析2022

    • 著者名/発表者名
      中村 翠, 熊沢 穣, 長尾 遼, 石川 規子, 沈建仁, 伊福 健太郎
    • 学会等名
      第18回京大植物縦横無尽の会ワークショップ(オンライン)
  • [学会発表] 有用物質生産に向けた実用藻類ツノケイソウの光合成機能の最適化2022

    • 著者名/発表者名
      伊福 健太郎
    • 学会等名
      第39回日本植物バイオテクノロジー学会 シンポジウム「藻類の多様性研究の持続的社会への貢献」
    • 招待講演
  • [備考] ChaetoBase v.1.1

    • URL

      https://chaetoceros.nibb.ac.jp/

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公開日: 2023-12-25  

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