| 研究課題/領域番号 |
20H03140
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| 研究機関 | 北海道大学 |
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研究代表者 |
五十嵐 学 北海道大学, 人獣共通感染症国際共同研究所, 准教授 (10374240)
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| 研究分担者 |
広川 貴次 筑波大学, 医学医療系, 教授 (20357867)
松野 啓太 北海道大学, 人獣共通感染症国際共同研究所, 准教授 (40753306)
阿部 貴志 新潟大学, 自然科学系, 教授 (30390628)
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| 研究期間 (年度) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| キーワード | フィロウイルス / エボラウイルス / マールブルグウイルス / 医薬分子設計 / 抗ウイルス薬 / 分子間相互作用 / 分子動力学 / 立体構造 |
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| 研究実績の概要 |
創薬標的となる相互作用/機能部位を新たに同定することはタンパク質の立体構造情報に基づく医薬品設計において重要である。
タンパク質の表面には、疎水性、正電荷、負電荷の傾向が強い領域（表面パッチ）が存在し、それぞれ疎水性パッチ、正電荷パッチ、負電荷パッチと呼ばれる。このようなパッチは分子間相互作用に重要な役割を果たしていると考えられている。つまり表面パッチを解析することで、ウイルスタンパク質上の新たな相互作用/機能部位を予測できる可能性がある。本年度は、疎水性パッチに着目し、VP35の機能探索を行った。パッチ解析の結果、VP35の表面にはこれまで機能との関連について報告のない疎水性パッチが存在していた。このパッチが機能に重要かを調べるため、パッチを消失させるアミノ酸置換をコンピュータ上で予測し、変異を導入したVP35を実際に作出した。変異VP35に対して、ルシフェラーゼ遺伝子をレポーターとしたミニゲノムアッセイを行った結果、この疎水性パッチにはポリメラーゼ補因子活性に関わる重要なアミノ酸残基が含まれていることが明らかになった。
また、共同研究者がクライオ電子顕微鏡解析で決定したマールブルグウイルスのヌクレオカプシドのコア構造であるウイルス核タンパク質-RNA 複合体（NP-RNA 複合体）の立体構造に対して、分子動力学計算を行いRNAとNPとの相互作用解析を行った。その結果、ゲノムRNAとの相互作用を担うNP蛋白質上のアミノ酸が、フィロウイルス種間で高度に保存されていることが明らかになった。すなわち、NP上のRNA結合領域も汎フィロウイルス治療薬の標的として機能する可能性が示唆された。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
新型コロナウイルス感染症の影響による共同研究先の制限のため、成果取りまとめに不可欠な解析実施が困難な状況が生じた。そのため、進捗はやや遅れている、
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| 今後の研究の推進方策 |
(1) 相互作用/機能部位を標的とする医薬分子の設計
既存薬ライブラリー等の化合物データを用いて、標的部位の活性ポケットに結合する化合物をインシリコスクリーニングにより探索する。また、PDBに登録されているウイルス蛋白質の複合体構造を基点に、相互作用部位を模倣したペプチドを設計する。
(2) 候補化合物の阻害活性試験
(1)の項で得られた分子について、蛋白質発現系を用いて阻害試験を行う。
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