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2022 年度 実績報告書

超高感度in cell NMRによるヒト生細胞内蛋白質の立体構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 20H03191
研究機関横浜国立大学

研究代表者

児嶋 長次郎  横浜国立大学, 大学院工学研究院, 教授 (50333563)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
キーワードNMR / 蛋白質 / 立体構造解析
研究実績の概要

蛋白質の分子機能は立体構造によって制御されている。NMRは細胞内の蛋白質を細胞が生きている状態のまま構造解析できる唯一の手法であるが、生細胞内での蛋白質の構造解析は再現性や検出感度に問題があり、今までヒト細胞中での構造決定の成功例はない。そこで、本研究では独自技術で超高感度化に成功した生細胞内NMR法(in vivo/in cell NMR)を用いてヒト生細胞内蛋白質の立体構造解析技術を開発する。また、超高感度化した生細胞内NMR法を発展させ、ヒト生細胞内の蛋白質の立体構造変化やリン酸代謝のリアルタイム計測を実現する。
本研究では上記研究目的を達成するために以下4つの研究項目を推進している。
項目(1):分子量6千のモデル蛋白質GB1とHeLa細胞を用い、ヒト生細胞内NMRの高品質データの取得方法を詳細に検討することで、生細胞内蛋白質の立体構造解析技術を確立する。項目(2):2D 1H-15N HSQCスペクトルを用いて15N核の緩和時間解析を行い、生細胞内蛋白質の主鎖の運動性評価技術を確立する。項目(3):時間分解能の高い2D 1H-15N HSQCスペクトルと1D 31Pスペクトルを用い、ヒト生細胞内の蛋白質の立体構造変化やリン酸代謝を分単位精度でリアルタイム検出する技術を確立する。項目(4):バッファー中とヒト細胞中での立体構造や運動性の違いを明らかにするとともに、蛋白質間相互作用や蛋白質薬剤相互作用など分子間相互作用の違いについても解析を進める。
2022年度は、上記研究項目(1)(2)(3)(4)を推進し、バッファー中とヒト細胞中での立体構造や運動性の違いを明らかにするとともに、薬剤と蛋白質との分子間相互作用の違いについても解析を進めた。また、ヒト生細胞内のリン酸代謝を分単位精度でリアルタイム検出することにも成功した。

現在までの達成度 (段落)

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2022 その他

すべて 国際共同研究 (3件) 雑誌論文 (8件) (うち国際共著 3件、 査読あり 8件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 2件、 招待講演 2件)

  • [国際共同研究] UConn Health(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      UConn Health
  • [国際共同研究] Czech Academy of Sciences/Czech Technical University(チェコ)

    • 国名
      チェコ
    • 外国機関名
      Czech Academy of Sciences/Czech Technical University
  • [国際共同研究] Korea Basic Science Institute/University of Science and Technology/Chungnam National University(韓国)

    • 国名
      韓国
    • 外国機関名
      Korea Basic Science Institute/University of Science and Technology/Chungnam National University
  • [雑誌論文] Biological Magnetic Resonance Data Bank2022

    • 著者名/発表者名
      Hoch Jeffrey C、Baskaran Kumaran、Burr Harrison、Chin John、Eghbalnia Hamid?R、Fujiwara Toshimichi、Gryk Michael?R、Iwata Takeshi、Kojima Chojiro、Kurisu Genji、Maziuk Dmitri、Miyanoiri Yohei、Wedell Jonathan?R、Wilburn Colin、Yao Hongyang、Yokochi Masashi
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 51 ページ: D368~D376

    • DOI

      10.1093/nar/gkac1050

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Multifunctional chemical inhibitors of the florigen activation?complex discovered by structure‐based high‐throughput screening2022

    • 著者名/発表者名
      Taoka Ken‐ichiro、Kawahara Ikumi、Shinya Shoko、Harada Ken‐ichi、Yamashita Eiki、Shimatani Zenpei、Furuita Kyoko、Muranaka Tomoaki、Oyama Tokitaka、Terada Rie、Nakagawa Atsushi、Fujiwara Toshimichi、Tsuji Hiroyuki、Kojima Chojiro
    • 雑誌名

      The Plant Journal

      巻: 112 ページ: 1337~1349

    • DOI

      10.1111/tpj.16008

    • 査読あり
  • [雑誌論文] NMR determination of the 2:1 binding complex of naphthyridine carbamate dimer (NCD) and CGG/CGG triad in double-stranded DNA2022

    • 著者名/発表者名
      Yamada Takeshi、Furuita Kyoko、Sakurabayashi Shuhei、Nomura Makoto、Kojima Chojiro、Nakatani Kazuhiko
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 50 ページ: 9621~9631

    • DOI

      10.1093/nar/gkac740

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Physicochemical Characterization of the Catalytic Unit of Hammerhead Ribozyme and Its Relationship with the Catalytic Activity2022

    • 著者名/発表者名
      Tanaka Yoshiyuki、Yamanaka Daichi、Morioka Saori、Yamaguchi Taishi、Morikawa Masayuki、Kodama Takashi S.、Sychrovsk? Vladim?r、Kojima Chojiro、Hattori Yoshikazu
    • 雑誌名

      Biophysica

      巻: 2 ページ: 221~239

    • DOI

      10.3390/biophysica2030022

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] <sup>19</sup>F chemical library and <sup>19</sup>F-NMR for a weakly bound complex structure2022

    • 著者名/発表者名
      Shinya Shoko、Katahira Ritsuko、Furuita Kyoko、Sugiki Toshihiko、Lee Young-Ho、Hattori Yoshikazu、Takeshita Kohei、Nakagawa Atsushi、Kokago Aoi、Akagi Ken-ichi、Oouchi Muneki、Hayashi Fumiaki、Kigawa Takanori、Takimoto-Kamimura Midori、Fujiwara Toshimichi、Kojima Chojiro
    • 雑誌名

      RSC Medicinal Chemistry

      巻: 13 ページ: 1100~1111

    • DOI

      10.1039/d2md00170e

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Crystal structure of potato 14-3-3 protein St14f revealed the importance of helix I in StFDL1 recognition2022

    • 著者名/発表者名
      Harada Ken-ichi、Furuita Kyoko、Yamashita Eiki、Taoka Ken-ichiro、Tsuji Hiroyuki、Fujiwara Toshimichi、Nakagawa Atsushi、Kojima Chojiro
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 12 ページ: 11596

    • DOI

      10.1038/s41598-022-15505-y

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 1H, 13C, and 15N resonance assignments of human glutathione peroxidase 42022

    • 著者名/発表者名
      Furuita Kyoko、Inomata Kouki、Sugiki Toshihiko、Kobayashi Naohiro、Fujiwara Toshimich、Kojima Chojiro
    • 雑誌名

      Biomolecular NMR Assignments

      巻: 16 ページ: 267~271

    • DOI

      10.1007/s12104-022-10090-7

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cooperative regulation of PBI1 and MAPKs controls WRKY45 transcription factor in rice immunity2022

    • 著者名/発表者名
      Ichimaru Kota、Yamaguchi Koji、Harada Kenichi、Nishio Yusaku、Hori Momoka、Ishikawa Kazuya、Inoue Haruhiko、Shigeta Shusuke、Inoue Kento、Shimada Keita、Yoshimura Satomi、Takeda Takumi、Yamashita Eiki、Fujiwara Toshimichi、Nakagawa Atsushi、Kojima Chojiro、Kawasaki Tsutomu
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 13 ページ: 2397

    • DOI

      10.1038/s41467-022-30131-y

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] NMR tools developed for drug discovery and its application to DNA targeting small molecules2022

    • 著者名/発表者名
      Chojiro Kojima
    • 学会等名
      The 7th International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 19F-STD NMR for 3D structure modeling of a weakly bound protein-drug complex2022

    • 著者名/発表者名
      Chojiro Kojima
    • 学会等名
      The 4th International Symposium of Structure-Based Drug Discovery & 2022 Annual Conference of the Korean Society for Structural Biology Joint Symposium
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2023-12-25  

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