| 研究課題/領域番号 |
20H03274
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| 研究機関 | 名古屋大学 |
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研究代表者 |
多田 安臣 名古屋大学, 遺伝子実験施設, 教授 (40552740)
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| 研究期間 (年度) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| キーワード | 植物免疫 / 疾病防御応答 / 植物ホルモン / サリチル酸 / 転写因子 |
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| 研究実績の概要 |
Dexamethasone（DEX）誘導性のGFP-SBRsおよび構造的に類似しているが認識シス配列が異なるSBR-likeのT3植物にDEXを処理し、RNA-seq解析を行なった結果、SBR依存的にSA合成関連遺伝子であるICS1やPBS3などの主要な遺伝子の発現を確認できた。また、DEX処理後24時間後では、SA応答性遺伝子であるPR1などの遺伝子群の発現も検出され、SBRの一過的発現でSA合成とSA応答が生じることが明らかになった。CRISPR-Cas9によってSBRシングルおよび多重変異体を作出し、UV処理を行ったところ、予想に反してICS1、PBS3などの遺伝子群がより強く発現した。先の結果と合わせると、SBRはリプレッサーであり、かつアクティベーターとしての機能を担うと考えられる。また、SBRのゲノムDNA上における分布を調査するため、上記GFP-SBRs植物を用いてChIP-seq解析を行なった。その結果、SA合成酵素であるPBS3やICS1プロモーター上に明確に結合していることを明らかにし、実際SBRはSA合成関連遺伝子群を標的としていることが明らかになった。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
SBRの機能解析は、RNA-seq、ChIP-seqを中心とした大規模解析によって順調に進んでいる。一方、多重変異体の表現型を説明するための実験が必要となったため、「おおむね順調」であるとした。
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| 今後の研究の推進方策 |
得られたChIP-seqのデータを他の関連因子のChIP-seqデータと照合し、過去に報告されていた事実に対しての説明を試みる。また、変異体がリプレッサーの表現型を示したことから、SBRの他のホモログの存在も示唆される。現在、その候補因子についても解析を進めている。
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