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抗菌薬ストレスに暴露された細菌は宿主内で生存し続けるための生存戦略として薬剤耐性を獲得する。抗菌薬適正使用等により薬剤耐性菌発生の抑制が試みられているが、医療現場で実践されている対策は薬剤耐性に至る細菌側のリスク因子は十分に考慮されておらず、医療行為と細菌の両側面から最適な薬剤耐性対策を構築することが望ましいと考えられる。本研究では抗菌薬を投与している患者から連続して分離され、経時的に薬剤耐性を獲得した臨床分離細菌のゲノム情報を相互比較することで薬剤耐性に至った過程を明らかにし、薬剤耐性菌発生防止に寄与することを目的としている。既に報告した宿主内ゲノム進化2症例に新たな解析症例を加えることで症例間でのゲノム進化の過程を相互比較するための独自の小規模ゲノムデータベースを拡張した。また、その過程で起こる遺伝子増幅機構を解明することに成功した。
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