ロングリードシーケンサーを活用した非コードリピート伸長病の病態解明研究

2022 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 20H03588
• 研究機関: 岡山大学
• 研究代表者: 石浦 浩之 岡山大学, 医歯薬学域, 教授 (40632849)
• 研究期間 (年度): 2020-04-01 – 2023-03-31
• キーワード: ロングリードシーケンサー / リピート伸長変異

研究実績の概要

近年、非コード領域のリピート伸長変異がてんかん、白質脳症、ミオパチーなど様々な疾患を呈することが明らかになり、その疾患概念が拡大している。また、これまでの申請者らの研究により、リピートモチーフと臨床像の間に密接な関係があることも明らかとなり、リピートモチーフ・表現型関連の概念が提唱された。本研究は、リピート伸長病の病態にせまると共に、治療法開発を目指す研究である。本年度は、眼咽頭遠位型ミオパチー1型の臨床遺伝学的検討を行い、臨床病型の広がりについて新規知見を見出し、論文として発表した。神経核内封入体病の新規患者の遺伝子解析を行う中で、画像上paravermal hyperintensityのみを呈する患者を見出し、報告した。また、既知のリピート伸長変異を有する患者のロングリードシーケンス解析より、リピートの全長解読を行った。新規の白質脳症家系、筋疾患家系、運動失調症家系の全ゲノム配列解析を行い、BWA-MEM2とGATKによる通常の変異解析に加えて、リピート伸長変異を含む統合的な解析を行った。

現在までの達成度 (段落)

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [雑誌論文] Recent advances in CGG repeat diseases and a proposal of fragile X-associated tremor/ataxia syndrome, neuronal intranuclear inclusion disease, and oculophryngodistal myopathy (FNOP) spectrum disorder. (2023)
  • 著者名/発表者名: Ishiura H, Tsuji S, Toda T.
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 68 ページ: 169-174
  • DOI: 10.1038/s10038-022-01116-y
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Insights into familial adult myoclonus epilepsy pathogenesis: How the same repeat expansion in six unrelated genes may lead to cortical excitability (2023)
  • 著者名/発表者名: Depienne Christel、van den Maagdenberg Arn M. J. M.、K?hnel Theresa、Ishiura Hiroyuki、Corbett Mark A.、Tsuji Shoji
  • 雑誌名: Epilepsia 巻: - ページ: -
  • DOI: 10.1111/epi.17504
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Proteomic profile of nuclei containing p62-positive inclusions in a patient with neuronal intranuclear inclusion disease (2023)
  • 著者名/発表者名: Kurihara Masanori、Mano Tatsuo、Eto Fumihiro、Yao Ikuko、Sato Kenichiro、Ohtomo Gaku、Bannai Taro、Shibata Shota、Ishiura Hiroyuki、Ikemura Masako、Matsubara Tomoyasu、Morishima Maho、Saito Yuko、Murayama Shigeo、Toda Tatsushi、Setou Mitsutoshi、Iwata Atsushi
  • 雑誌名: Neurobiology of Disease 巻: 177 ページ: 105989～105989
  • DOI: 10.1016/j.nbd.2023.105989
  • 査読あり
• [雑誌論文] Copper Deficiency in Wilson's Disease with a Normal Zinc Value (2023)
  • 著者名/発表者名: Ueda Masayuki、Katsuse Kazuto、Kakumoto Toshiyuki、Kobayashi Satoshi、Ishiura Hiroyuki、Mitsui Jun、Toda Tatsushi
  • 雑誌名: Internal Medicine 巻: 62 ページ: 1073～1076
  • DOI: 10.2169/internalmedicine.9366-22
  • 査読あり
• [雑誌論文] Asymptomatic myocardial infarction in a patient with myotonic dystrophy type 1 (2022)
  • 著者名/発表者名: Seki Yuka、Yamada Takanobu、Kiyosue Arihiro、Kimura Koichi、Uehara Masae、Hatano Masaru、Sasako Takayoshi、Shirota Yuichiro、Sudo Atsushi、Ishiura Hiroyuki、Toda Tatsushi、Yamauchi Toshimasa、Komuro Issei
  • 雑誌名: Journal of Cardiology Cases 巻: 26 ページ: 248～251
  • DOI: 10.1016/j.jccase.2022.05.004
  • 査読あり
• [雑誌論文] Expanded clinical spectrum of oculopharyngodistal myopathy type 1 (2022)
  • 著者名/発表者名: Shimizu Takahiro、Ishiura Hiroyuki、Hara Manato、Shibata Shota、Unuma Atsushi、Kubota Akatsuki、Sakuishi Kaori、Inoue Kiyoharu、Goto Jun、Takahashi Yuji、Shirota Yuichiro、Hamada Masashi、Shimizu Jun、Tsuji Shoji、Toda Tatsushi
  • 雑誌名: Muscle Nerve 巻: 66 ページ: 679～685
  • DOI: 10.1002/mus.27717
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isolated Paravermal Hyperintensities in Neuronal Intranuclear Inclusion Disease (2022)
  • 著者名/発表者名: Tokimura Ryo、Hashimoto Maeda Meiko、Mitsutake Akihiko、Sakai Souichi、Suzuki Fumio、Sugasawa Keiko、Fujimoto Chisato、Ishiura Hiroyuki、Toda Tatsushi
  • 雑誌名: Neurology 巻: 98 ページ: 938～939
  • DOI: 10.1212/WNL.0000000000200590
  • 査読あり
• [学会発表] ハンチントン病の病因遺伝子 (2022)
  • 著者名/発表者名: 石浦浩之
  • 学会等名: 日本神経学会学術大会
  • 招待講演
• [学会発表] 神経筋疾患における新規リピート伸長病の発見 (2022)
  • 著者名/発表者名: 石浦浩之
  • 学会等名: 日本神経学会学術大会
  • 招待講演
• [学会発表] 眼咽頭遠位型ミオパチー 1型 7例の臨床病理学的検討 (2022)
  • 著者名/発表者名: 清水崇紘，石浦浩之，原愛徒，柴田頌太，鵜沼敦，久保田暁，作石かおり，井上聖啓，後藤順，高橋祐二，代田悠一郎，濱田雅，清水潤，辻省次，戸田達史
  • 学会等名: 日本筋学会
• [学会発表] Expanded CGG repeats in oculopharyngodistal myopathy and related disorders (2022)
  • 著者名/発表者名: Ishiura H
  • 学会等名: 12th Japanese-French Workshop “New insights in personalized medicine for neuromuscular diseases: From Basic to Applied Myology”
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] A single-center genetic analysis of oculopharyngeal myopathy (2022)
  • 著者名/発表者名: Takahiro Shimizu, Hiroyuki Ishiura, Manato Hara, Shota Shibata, Atsushi Unuma, Akatsuki Kubota, Kaori Sakuishi, Kiyoharu Inoue, Jun Goto, Yuji Takahashi, Yuichiro Shirota, Masashi Hamada, Jun Shimizu, Shoji Tsuji, Tatsushi Toda
  • 学会等名: American Society of Human Genetics 2022
  • 国際学会
• [学会発表] Landscape of HSPs in Japan and Japan Spastic Paraplegia Research Consortium (JASPAC) (2022)
  • 著者名/発表者名: Ishiura H
  • 学会等名: TreatHSP/TWS Symposium 2022
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 神経筋疾患におけるロングリードシーケンシングの役割 (2022)
  • 著者名/発表者名: 石浦浩之
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会
  • 招待講演