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2022 年度 実績報告書

神経膠腫における腫瘍進化的トラジェクションの解明と次世代個別化医療の探索

研究課題

研究課題/領域番号 20H03789
研究機関名古屋大学

研究代表者

夏目 敦至  名古屋大学, 未来社会創造機構, 特任教授 (30362255)

研究分担者 大岡 史治  名古屋大学, 医学系研究科, 講師 (10725724)
日野原 邦彦  名古屋大学, 医学系研究科, 特任准教授 (50549467)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
キーワード脳腫瘍 / ゲノム
研究実績の概要

我々の基盤研究(Aoki, Natsume, Nat Genet, 2015. Neuro-Oncol 2018)などにより脳腫瘍、特に神経膠腫のゲノム異常が明らかになりつつある。神経膠腫の8割はIDH変異が腫瘍発生に関与し、乏突起膠腫系と星細胞腫系の系譜に分かれ、それぞれ特有の遺伝子変化を獲得しながら、時間空間的に指向性を持って悪性転化・進展する(腫瘍進化的トラジェクション)。また神経膠腫の残り2割はEZH2によるヒストンメチル化が腫瘍発生の契機となる(Ohka, Natsume, Cancer Res, 2019)。予後改善には腫瘍発生から診断から悪性転化から腫瘍死という時間軸のなかで悪性転化を抑制・遅延することが鍵となる。しかしIDH1変異、EZH2過剰発現後、悪性転化に向かう時間空間的な指向は依然不明である。これまでは腫瘍塊からエクソン、RNA、DNAメチル化、全ゲノム、ヒストン修飾を次世代シークエンスして知見を得てきた。そして今後は単一細胞解析が主流となると考えられるが不均一細胞群の個々の標識などに障壁がある。本研究では、単一細胞をDNAバーコードラベルし、20,000種類の単一遺伝子をCRISPR/Cas9ノックアウトするという我々が樹立した新規アプローチで、腫瘍進化的トラジェクションを明らかにすることができた。これにより、次世代個別化医療を目指す基盤ができた。

現在までの達成度 (段落)

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2023

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 2件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 1件、 招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Defining super-enhancers by highly ranked histone H4 multi-acetylation levels identifies transcription factors associated with glioblastoma stem-like properties2023

    • 著者名/発表者名
      Das Nando D.、Chang Jen-Chien、Hon Chung-Chau、Kelly S. Thomas、Ito Shinsuke、Lizio Marina、Kaczkowski Bogumil、Watanabe Hisami、Katsushima Keisuke、Natsume Atsushi、Koseki Haruhiko、Kondo Yutaka、Minoda Aki、Umehara Takashi
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: 24 ページ: 0

    • DOI

      10.1186/s12864-023-09659-w

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Prediction of Tumor Development and Urine-Based Liquid Biopsy for Molecule-Targeted Therapy of Gliomas2023

    • 著者名/発表者名
      Kurimoto Michihiro、Rockenbach Yumi、Kato Akira、Natsume Atsushi
    • 雑誌名

      Genes

      巻: 14 ページ: 1201~1201

    • DOI

      10.3390/genes14061201

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Haploinsufficiency of NFKBIA reshapes the epigenome antipodal to the IDH mutation and imparts disease fate in diffuse gliomas2023

    • 著者名/発表者名
      Bredel Markus、Espinosa Llus、Kim Hyunsoo、Scholtens Denise M.、McElroy Joseph P.、Rajbhandari Rajani、Meng Wei、Kollmeyer Thomas M.、Malta Tathiane M.、Quezada Michael A.、Natsume Atsushi、Ogawa Seishi、Weber Ruthild G.、Pugh Stephanie L.、Chakravarti Arnab
    • 雑誌名

      Cell Reports Medicine

      巻: 4 ページ: 101082~101082

    • DOI

      10.1016/j.xcrm.2023.101082

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Mutation detection of urinary cell-free DNA via catch-and-release isolation on nanowires for liquid biopsy2023

    • 著者名/発表者名
      Takahashi Hiromi、Yasui Takao、Hirano Masaki、Shinjo Keiko、Miyazaki Yusuke、Shinoda Wataru、Hasegawa Takeshi、Natsume Atsushi、Kitano Yotaro、Ida Mikiko、Zhang Min、Shimada Taisuke、Paisrisarn Piyawan、Zhu Zetao、Ohka Fumiharu、Aoki Kosuke、Rahong Sakon、Nagashima Kazuki、Yanagida Takeshi、Baba Yoshinobu
    • 雑誌名

      Biosensors and Bioelectronics

      巻: 234 ページ: 115318~115318

    • DOI

      10.1016/j.bios.2023.115318

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Easy-to-use machine learning system for the prediction of IDH mutation and 1p/19q codeletion using MRI images of adult-type diffuse gliomas2023

    • 著者名/発表者名
      Nishikawa Tomohide、Ohka Fumiharu、Aoki Kosuke、Suzuki Hiromichi、Motomura Kazuya、Yamaguchi Junya、Maeda Sachi、Kibe Yuji、Shimizu Hiroki、Natsume Atsushi、Innan Hideki、Saito Ryuta
    • 雑誌名

      Brain Tumor Pathology

      巻: 40 ページ: 85~92

    • DOI

      10.1007/s10014-023-00459-4

    • 査読あり
  • [学会発表] Urine-based genetic diagnosis of brain tumors.2023

    • 著者名/発表者名
      Atsushi NATSUME, Takao YASUI, Yoshinobu BABA
    • 学会等名
      FIBER International Summit for Nucleic Acids 2023
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] DNA/RNAを移動する電子速度の測定によるIDH1変異の検出2023

    • 著者名/発表者名
      夏目敦至、Fun Shuya, 平野雅規、高山和也、橋本克訓、丸山 厚、藤塚 守
    • 学会等名
      第41回日本脳腫瘍病理学会
  • [学会発表] Urine-based genetic diagnosis of brain tumors2023

    • 著者名/発表者名
      Atsushi NATSUME, Takao YASUI, Yoshinobu BABA
    • 学会等名
      第61回日本癌治療学会
    • 招待講演

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公開日: 2024-12-25  

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