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De novo DNAメチル化酵素を欠損させた女性多能性幹細胞では、X染色体不活化の不可逆的破綻が回避されることを明らかにした。さらに、キーとなるlong non-cording RNA XIST遺伝子へのDNAメチル化は、ゲノム編集によるDNA二本鎖切断により脱メチル化される現象を見出し、女性多能性幹細胞におけるX染色体不活化のレスキューに成功している。
これらの株において、De novo DNAメチル化の欠損における転写の影響を解析したところ、劇的な差は見られなかったものの、naive化させることでユニークな転写状態を示すことを見出した。
一方、DNAメチル化状態においてはRRBS解析からヒト初期胚内部細胞塊と比較解析したところ、ヒト多能性幹細胞特異的なゲノムワイドなDNAメチル化上昇が、De novo DNAメチル化欠損株においては、軽減されることが明かとなった。これらの株は、より詳細な転写・DNAメチル化相関解析を実施するとともに、初期胚モデリングへ活用することで、ヒト初期発生原理におけるDe novo DNAメチル化の意義を解明する発展型研究を目指す。
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