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2021 年度 実績報告書

ミクロ神経細胞ネットワークの広域非一様性の原理解明

研究課題

研究課題/領域番号 20H04257
研究機関京都大学

研究代表者

下野 昌宣  京都大学, 医学研究科, 准教授 (30552137)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2024-03-31
キーワードNetwork / Deep Neural Nework / Cortex / nonuniformity / data generation / Artificial Intelligence / Multielectrode recording / Immunostaining
研究実績の概要

私たちは、脳や神経データを体系的に取得するwet系の実験と、ネットワーク科学や人工知能の技術を活用したdry系の解析を両面として進める、新たな研究の展開を試みてまいりました。以下に成果をリストします。(1) 一つの脳皮質領域の神経細胞ネットワークに対してネットワークサイエンス解析を行い、抑制細胞がネットワークのハブ的位置づけにあることを明らかとしました。この知見は、神経科学に極めて原理的なものですが、広く評価されたことはありませんでした。(2) 上と同じデータを用いて、オートエンコーダという人工ニューラルネットワークの一種を適用して、トポロジー的特徴を自動的に抽出・解釈する技術を開発し、人では直感的に分からないデータの傾向を明らかとしました。具体的には、複数のトポロジーのブレンドが、その非一様性を効果的に説明することを明らかとしました。(3) 1の方法の実験の適用域を拡張し、12個の脳領域のトポロジーを幅広く比較しました。その結果、前頭部が他領域と比べて、極めて特殊な内部での接続構造を有していることを明らかとしました。(4) 時系列を取り扱うことのできる深層神経ネットワークの一種を、複数領域のデータに適用し、神経活動のスパイクデータを生成することに成功しました。この研究により、異なる脳領域間でも神経活動の相互生成が可能であることが判明しました。(5) 3の分析を、精神疾患モデルマウスの前頭部のデータに適用し、健常群と疾患群の差異を明らかとしました。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

当初計画していた領域間の比較は完了し、そのデータに対して、計画当初には用意していなかったデータ生成の手法を適用する事で、未踏の展開が進んだため。

今後の研究の推進方策

極めて重要な展開を用意しているが、公開はできない段階である。5の成果に関して、今後まとめてゆく必要がある。

  • 研究成果

    (10件)

すべて 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (6件) (うち招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Deep neural generation of neuronal spikes2023

    • 著者名/発表者名
      Nakajima Ryota、Shirakami Arata、Tsumura Hayato、Matsuda Kouki、Nakamura Eita、Shimono Masanori
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: 1 ページ: 1-17

    • DOI

      10.1101/2023.03.05.531237

  • [雑誌論文] Whole brain evaluation of cortical micro-connectomes2022

    • 著者名/発表者名
      Matsuda Kouki、Shirakami Arata、Nakajima Ryota、Akutsu Tatsuya、Shimono Masanori
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: 1 ページ: 1-20

    • DOI

      10.1101/2022.10.05.510240

  • [雑誌論文] Inhibitory neurons exhibit high controlling ability in the cortical microconnectome2021

    • 著者名/発表者名
      Kajiwara Motoki、Nomura Ritsuki、Goetze Felix、Kawabata Masanori、Isomura Yoshikazu、Akutsu Tatsuya、Shimono Masanori
    • 雑誌名

      PLOS Computational Biology

      巻: 17 ページ: 1008846~1008846

    • DOI

      10.1371/journal.pcbi.1008846

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Neural network embedding of functional microconnectome2021

    • 著者名/発表者名
      Shirakami Arata、Hase Takeshi、Yamaguchi Yuki、Shimono Masanori
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: 1 ページ: 1-22

    • DOI

      10.1101/2021.10.19.464982

  • [学会発表] Whole brain comparison of effective cortical micro-connectome.2022

    • 著者名/発表者名
      Matsuda K., Shirakami A., Nakajima R., Yamaguchi Y., Shimono M.
    • 学会等名
      Organization for Computational Neuroscience
  • [学会発表] Network properties of the medial prefrontal cortex altered by chronic social stress in mice.2022

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi Y., Hase T., Shirakami A., Shinohara R., Kitaoka S., Furuyashiki T., Shimono M.
    • 学会等名
      Organization for Computational Neuroscience
  • [学会発表] Whole brain comparison of functional microconnectome2022

    • 著者名/発表者名
      Shimono M.
    • 学会等名
      Network Neuroscience2022
    • 招待講演
  • [学会発表] Whole brain comparison of E/I categorized informatic microconnectome and the application.2022

    • 著者名/発表者名
      Shimono M.
    • 学会等名
      CNS*2022 Workshop on Methods of Information Theory in Computational Neuroscience
    • 招待講演
  • [学会発表] Deep neural embedding of neuronal connectivity.2021

    • 著者名/発表者名
      Shirakami A., Shimono M.
    • 学会等名
      Organization for Computational Neuroscience
  • [学会発表] Prediction of clinical symptoms based on global cortical thinning patterns in Parkinson's disease.2021

    • 著者名/発表者名
      Kikuchi S., Shimono M.
    • 学会等名
      Organization for Computational Neuroscience

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公開日: 2023-12-25  

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