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2021 年度 実績報告書

転写と中核的な生命機能を結びつける高次複合体の構造基盤

研究課題

研究課題/領域番号 20H05690
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

関根 俊一  国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, チームリーダー (50321774)

研究分担者 鯨井 智也  東京大学, 定量生命科学研究所, 助教 (70823566)
研究期間 (年度) 2020-08-31 – 2025-03-31
キーワードRNAポリメラーゼ / ヌクレオソーム / 転写伸長因子 / ヒストンシャペロン / 転写終結因子 / クライオ電子顕微鏡
研究実績の概要

DNAの遺伝情報をRNAに転写する巨大なタンパク質複合体であるRNAポリメラーゼは、細胞内の多数の分子と相互作用し、様々な生命機能を支えるハブとして機能している。しかしながら、転写と様々な機能との接点で形成される分子の実体やその構造、機能や制御のメカニズムはほとんど分かっていない。これらの高次複合体の構造解析を行い、重要な生命機能の分子メカニズムを解明するために、本年度は以下のように研究を進めた。
真核生物の核内では、DNAはヌクレオソームを基本単位とするクロマチン構造を形成している。我々はこれまでに、RNAポリメラーゼII (RNAP II)がヌクレオソームを転写する際に形成される複合体の構造をクライオ電子顕微鏡を用いて解析する手法を確立してきた。今年度は、RNAP IIがヌクレオソームを通過するのを助け、通過後にヌクレオソームを再生させるタンパク質因子を含む複合体の解析を進めた。また、リンカーヒストンが結合したヌクレオソームを用いた解析を行い、リンカーヒストンが転写に阻害的に働くメカニズムの一端を明らかにした。乳がん細胞で局所的に発現し、転写領域からヌクレオソームを除去する効果を持った非コードRNAについての解析から、そのメカニズムを示唆する結果を得た。
細菌では、RNAポリメラーゼ (RNAP)によって転写されつつあるmRNAにリボソームが結合し、転写と翻訳は同調して行われる。また、リボソームによるmRNAの翻訳が完了すると、リボソームと入れ替わりに転写終結因子RhoがRNAPに結合して転写を終結させる。昨年度に引き続き、転写中のRNAPにリボソーム小サブユニットが結合して翻訳を開始する複合体の構造解析を進めた。また、RNAPから伸びる新生RNAにRhoが結合した複合体の構造解析を進めた。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

RNAP II-ヌクレオソームの転写系に転写伸長因子やヒストンシャペロン、非コードRNAを加え、形成される複合体の構造解析が順調に進んでいる。また、細菌に特有のRNAP-リボソーム複合体やRNAP-Rho複合体の構造解析も順調に進んでいる。

今後の研究の推進方策

引き続き、RNAポリメラーゼを中心に形成される種々の巨大複合体の調製・再構成を行い、クライオ電子顕微鏡解析を主体とした構造解析を行う。真核生物のRNAP II-ヌクレオソームの転写系や細菌の巨大複合体について、構造解析を進めていく。必要に応じてタンパク質因子やRNA因子を変更したり、核酸のデ ザインの変更等の工夫を凝らして進め、真核生物および原核生物の細胞内における転写制御や転写と他の機能との接点の実体の解明に取り組む。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2021 その他

すべて 学会発表 (1件) (うち招待講演 1件) 図書 (2件) 備考 (1件)

  • [学会発表] 理研横浜クライオ電子顕微鏡施設2021

    • 著者名/発表者名
      関根俊一
    • 学会等名
      日本分子生物学会 第44回年会
    • 招待講演
  • [図書] RNA Polymerases as Molecular Motors: On the Road2021

    • 著者名/発表者名
      Sekine, S., Uejima, T., Ehara, H. (ed. Robert Landick, Terence Strick, Jue Wang)
    • 総ページ数
      252
    • 出版者
      Royal Society of Chemistry
  • [図書] エピゲノムで新たな解明が進む「先天性疾患」2021

    • 著者名/発表者名
      大角健、鯨井智也、胡桃坂仁志 (副島英伸、秦健一郎編)
    • 総ページ数
      224
    • 出版者
      株式会社メディカル ドゥ
  • [備考] 理化学研究所 生命機能科学研究センター 転写制御構造生物学研究チーム

    • URL

      https://www.bdr.riken.jp/jp/research/labs/sekine-s/index.html

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公開日: 2023-12-25  

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