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2022 年度 実績報告書

べん毛モーター固定子の構造変化により生じるエネルギー変換機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 20J00329
研究機関大阪大学

研究代表者

錦野 達郎  大阪大学, 大阪大学蛋白質研究所, 特別研究員(PD) (80884428)

研究期間 (年度) 2020-04-24 – 2023-03-31
キーワードSodium channel / Bacterial flagellum / Energy conversion / Flagellar stator / PomAPomB / Solution NMR / Cryo-EM / Single particle analysis
研究実績の概要

細菌の運動器官の一つであるべん毛は、回転するモーターをもつ超分子複合体である。モーターは自身が回転する「回転子」と回転子の周りに集合しイオンチャネルとして機能する「固定子」の2種類の複合体から成る。モーターの回転は、固定子への共役イオンの流入とカップルした回転子と固定子の相互作用により、膜内外に形成される電気化学ポテンシャルが運動エネルギーに変換されることで生じる。固定子は、5分子のA(PomA)と2分子のB(PomB)のサブユニットからなる膜貫通タンパク質複合体である。その構造はクライオ条件下での単粒子解析により明らかになっているが、エネルギー変換の際の複合体の構造変化や共役イオンの通り道は未だによくわかっていない。本研究では、これらを明らかにするため、クライオ条件での単粒子解析と溶液核磁気共鳴法(NMR)によりにNa+チャネルである海洋性ビブリオ菌の固定子複合体[PomAPomB]の構造情報を取得と、申請者のこれらの手法の習熟を目的としていた。
3年間の研究により、単粒子解析では、複合体の近原子分解能のクライオマップを構築し、モデル構造の構築と精密化ができた。溶液NMRでの解析では、複合体試料の測定を行ったところ、Na+濃度に依存したスペクトルの変化が見られた。これらの結果を基にして、共役イオンが固定子複合体をどのように通ることにより、回転子を回転させるのかに関して論文の執筆を進めている。これらの成果から、申請者はクライオ条件での単粒子解析と溶液NMRによる構造解析技術を習得できた。
また関連した研究として、高度好熱菌の固定子Aサブユニット(MotA)複合体の単粒子解析では、MotAのみで5量体を形成する内容を論文にまとめ、受理された。回転子を構成するタンパク質の一つであるFliGの溶液NMR解析の内容は論文を投稿し、リバイスが帰ってきており対応を進めている。

現在までの達成度 (段落)

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (11件)

  • [雑誌論文] Structure of MotA, a flagellar stator protein, from hyperthermophile2022

    • 著者名/発表者名
      Nishikino Tatsuro、Takekawa Norihiro、Tran Duy Phuoc、Kishikawa Jun-ichi、Hirose Mika、Onoe Sakura、Kojima Seiji、Homma Michio、Kitao Akio、Kato Takayuki、Imada Katsumi
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 631 ページ: 78~85

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2022.09.072

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Function and Structure of FlaK, a Master Regulator of the Polar Flagellar Genes in Marine <i>Vibrio</i>2022

    • 著者名/発表者名
      Homma Michio、Kobayakawa Tomoya、Hao Yuxi、Nishikino Tatsuro、Kojima Seiji
    • 雑誌名

      Journal of Bacteriology

      巻: 204 ページ: -

    • DOI

      10.1128/jb.00320-22

    • 査読あり
  • [学会発表] クライオ電子顕微鏡単粒子解析による海洋性ビブリオ菌のNa+駆動型PomAPomB固定子のイオン透過経路の解明2023

    • 著者名/発表者名
      〇錦野達郎、竹川宜宏、岸川淳一、廣瀬未果、小嶋誠司、本間道夫、加藤貴之、今田勝巳
    • 学会等名
      2022年度生物物理学会中部支部講演会
  • [学会発表] ビブリオ菌固定子PomAPomBの単粒子解析によるイオン結合部位の解析2023

    • 著者名/発表者名
      〇錦野達郎、竹川宜宏、岸川淳一、廣瀬未果、小嶋誠司、本間道夫、加藤貴之、今田勝巳
    • 学会等名
      2022年度べん毛交流会
  • [学会発表] 細菌べん毛モーターエネルギー変換複合体の膜貫通領域とペプチドグリカン結合領域をつなぐリンカー領域の機能解析2023

    • 著者名/発表者名
      〇宮村優輔、錦野達郎、本間道夫、小嶋誠司
    • 学会等名
      日本生体エネルギー研究会第48回討論会
  • [学会発表] 海洋性ビブリオ菌べん毛モーター固定子タンパク質PomBのリンカー領域機能解析2023

    • 著者名/発表者名
      〇宮村優輔、錦野達郎、本間道夫、小嶋誠司
    • 学会等名
      2022年度べん毛交流会
  • [学会発表] クライオ電子顕微鏡単粒子解析による海洋性ビブリオ菌べん毛モーター固定子 PomAPomB のイオン透過経路の解明2022

    • 著者名/発表者名
      〇錦野達郎, 竹川宜宏,岸川淳一, 廣瀬未果, 小嶋誠司, 本間道夫, 加藤貴之, 今田勝巳
    • 学会等名
      日本生体エネルギー研究会第48回討論会
  • [学会発表] 海洋性ビブリオ菌べん毛の回転方向を制御するタンパク質 FliG の高圧 NMR による構造解析2022

    • 著者名/発表者名
      〇錦野達郎,小嶋誠司, 本間道夫, 宮ノ入洋平
    • 学会等名
      第63回高圧討論会
  • [学会発表] Atomic structure of Na+ conducting flagellar energy convertor, the PomAB complex from Vibrio alginolyticus, by Cryo-EM2022

    • 著者名/発表者名
      〇錦野達郎, 竹川宜宏,岸川淳一, 廣瀬未果, 小嶋誠司, 本間道夫, 加藤貴之, 今田勝巳
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
  • [学会発表] メチオニン側鎖メチル基の信号観測による細菌べん毛モーター固定子のNa+イオン結合による構造変化の解析2022

    • 著者名/発表者名
      〇錦野達郎,小嶋誠司, 本間道夫, 宮ノ入洋平
    • 学会等名
      第61回NMR討論会
  • [学会発表] Vibrio べん毛モーター固定子複合体の Cryo-EM による単粒子解析2022

    • 著者名/発表者名
      〇錦野達郎, 竹川宜宏,岸川淳一, 廣瀬未果, 小嶋誠司, 本間道夫, 加藤貴之, 今田勝巳
    • 学会等名
      第54回ビブリオシンポジウム
  • [学会発表] Vibrioべん毛モーターのMSリングとCリングの構成タンパク質FliFとFliGとの融合タンパク質を大腸菌で作らせる2022

    • 著者名/発表者名
      〇本間道夫、錦野達郎、高橋幹士、福嶋優理亜、ハオ雨希、梶野洸樹、内橋貴之、小嶋誠司
    • 学会等名
      第54回ビブリオシンポジウム
  • [学会発表] Cryo-EM structure analysis of the PomAB complex, a bacterial flagellar stator of sodium-driven motor in Vibrio alginolyticus2022

    • 著者名/発表者名
      〇Tatsuro Nishikino, Norihiro Takekawa, Jun-ichi Kishikawa, Mika Hirose, Seiji Kojima, Michio Homma, Takayuki Kato, Katsumi Imada
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会

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公開日: 2023-12-25  

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