• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2022 年度 実績報告書

シングルセルアンプリコミクスによる癌進化系譜の解明

研究課題

研究課題/領域番号 20J01794
研究機関国立研究開発法人国立がん研究センター

研究代表者

中山 淳  国立研究開発法人国立がん研究センター, 細胞情報学分野, 特別研究員(PD) (30801237)

研究期間 (年度) 2020-04-24 – 2023-03-31
キーワードDCIS / scRNA-seq / 不均一性 / VARIED / 定量的ネットワークトポロジー / HER2陽性乳癌 / 浸潤性乳管がん / 乳がん
研究実績の概要

令和4年度の研究成果として、収集した臨床検体のシングルセルRNA-seq解析を実施し、LuminalサブタイプDCIS検体、Luminal-HER2サブタイプDCIS検体、Luminalサブタイプ原発腫瘍、HER2陽性サブタイプ原発腫瘍の統合解析を行った。その結果、DCISに特徴的な遺伝子をシングルセルレベルで抽出することに成功した。また、DCISですでにERBB2遺伝子増幅領域に含まれる遺伝子が複数発現上昇していることを見出した。
さらに、定量的ネットワークトポロジーを用いた遺伝子発現不均一性の解析VARIED法を開発した。このVARIED法を適用することで、乳がんにおける間質細胞の不均一性の増大を見出した。これらの結果は従来の知見をサポートするものであり、不均一性を定量的に議論することが可能となった。
これらの結果を統合し、Cancer Research誌に成果を報告した(Tokura and Nakayama (Co-first) et al., Cancer Research, 2022)。
当初の計画以上に進展しており、新たなシングルセル解析手法の開発に取り組む予定である。
現在は、本研究課題をさらに発展させ、浸潤性小葉がんのシングルセル・空間トランスクリプトーム解析やVARIED法の適用拡張のための共同研究を推進している。

現在までの達成度 (段落)

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (28件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (22件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Aberrant accumulation of NIK promotes tumor growth by dysregulating translation and post-translational modifications in breast cancer2023

    • 著者名/発表者名
      Hayashi Yusuke、Nakayama Jun、Yamamoto Mizuki、Maekawa Masashi、Watanabe Shinya、Higashiyama Shigeki、Inoue Jun-ichiro、Yamamoto Yusuke、Semba Kentaro
    • 雑誌名

      Cancer Cell International

      巻: 23 ページ: -

    • DOI

      10.1186/s12935-023-02904-y

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] HOXB7 induces STAT3‐mediated transformation and lung metastasis in immortalized mammary gland NMuMG cells2023

    • 著者名/発表者名
      Azuma Kazushi、Sakamoto Mai、Katayama Shota、Matsui Atsuka、Nakamichi Kazuya、Goshima Naoki、Watanabe Shinya、Nakayama Jun、Semba Kentaro
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 28 ページ: 277~287

    • DOI

      10.1111/gtc.13009

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Expressional Diversity and Cancer-prone Phenotypes in Cigarette-smoking Lungs at Single Cell Resolution2023

    • 著者名/発表者名
      Nakayama Jun、Yamamoto Yusuke
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: -

    • DOI

      10.1101/2021.12.09.472029

  • [雑誌論文] Anomalous Epithelial Variations and Ectopic Inflammatory Response in Chronic Obstructive Pulmonary Disease2022

    • 著者名/発表者名
      Watanabe Naoaki、Fujita Yu、Nakayama Jun、Mori Yutaro、Kadota Tsukasa、Hayashi Yusuke、Shimomura Iwao、Ohtsuka Takashi、Okamoto Koji、Araya Jun、Kuwano Kazuyoshi、Yamamoto Yusuke
    • 雑誌名

      American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology

      巻: 67 ページ: 708~719

    • DOI

      10.1165/rcmb.2021-0555oc

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Single-Cell Transcriptome Profiling Reveals Intratumoral Heterogeneity and Molecular Features of Ductal Carcinoma In Situ2022

    • 著者名/発表者名
      Tokura Momoko、Nakayama Jun、Prieto-Vila Marta、Shiino Sho、Yoshida Masayuki、Yamamoto Tomofumi、Watanabe Naoaki、Takayama Shin、Suzuki Yutaka、Okamoto Koji、Ochiya Takahiro、Kohno Takashi、Yatabe Yasushi、Suto Akihiko、Yamamoto Yusuke
    • 雑誌名

      Cancer Research

      巻: 82 ページ: 3236~3248

    • DOI

      10.1158/0008-5472.can-22-0090

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of two cancer stem cell-like populations in triple-negative breast cancer xenografts2022

    • 著者名/発表者名
      Nakayama Jun、Matsunaga Hiroko、Arikawa Koji、Yoda Takuya、Hosokawa Masahito、Takeyama Haruko、Yamamoto Yusuke、Semba Kentaro
    • 雑誌名

      Disease Models & Mechanisms

      巻: 15 ページ: -

    • DOI

      10.1242/dmm.049538

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 遺伝子発現不均一性を定量化するVARIED解析手法の開発2023

    • 著者名/発表者名
      中山淳, 山本雄介
    • 学会等名
      文部科学省新学術領域研究学術研究支援基盤形成「先端モデル動物支援プラットフォーム」2022年度成果発表会
  • [学会発表] 公共データベースを利用した1細胞メタ解析2022

    • 著者名/発表者名
      中山淳
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
  • [学会発表] 1細胞解析が明らかにする喫煙肺の細胞・遺伝子発現多様性2022

    • 著者名/発表者名
      中山淳, 山本雄介
    • 学会等名
      第81回日本癌学会学術総会
  • [学会発表] 乳がんにおけるがん幹細胞様集団の腫瘍内不均一性2022

    • 著者名/発表者名
      中山淳, 仙波憲太郎, 山本雄介
    • 学会等名
      第31回日本がん転移学会学術集会・総会
  • [学会発表] 野生型FLT3を標的とした新規シーズ化合物の創製と評価2022

    • 著者名/発表者名
      中山淳
    • 学会等名
      第26回日本がん分子標的治療学会学術集会
  • [学会発表] 同所性移植手法を用いたNMuMG-HOXB7細胞の転移能評価2022

    • 著者名/発表者名
      東和志, 中山淳, 仙波憲太郎
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会
  • [学会発表] 野生型FLT3陽性多発性骨髄腫に対する新規阻害剤の合成2022

    • 著者名/発表者名
      山元智史, 森屋亮平, 中山淳, 落谷孝広, 山本雄介
    • 学会等名
      第81回日本癌学会学術総会
  • [学会発表] 単一細胞発現解析による肺癌の腫瘍微小環境の比較解析2022

    • 著者名/発表者名
      平野悠太, 中山淳, 山元智史, 藤田雄, 山本雄介
    • 学会等名
      第81回日本癌学会学術総会
  • [学会発表] Single-cell RNA sequencing解析を用いたHER2陽性乳癌の腫瘍内遺伝子発現差異解析2022

    • 著者名/発表者名
      椎野翔, 中山淳, 都倉桃子, 山本雄介, 吉田正行
    • 学会等名
      第81回日本癌学会学術総会
  • [学会発表] シングルセルRNAシークエンスによるDCISの腫瘍内不均一性と分子的特徴の解明2022

    • 著者名/発表者名
      都倉桃子, 中山淳, プリエトビラ マルタ, 椎野翔, 吉田正行, 山本雄介
    • 学会等名
      第81回日本癌学会学術総会
  • [学会発表] 細胞間コミュニケーションにおける造骨性前立腺癌骨転移メカニズムの解明2022

    • 著者名/発表者名
      伊藤景紀, 山元智史, 佐藤峻, 中山淳, 島崎猛夫, 占部文彦, 木村高弘, 頴川晋, 落谷孝広, 山本雄介
    • 学会等名
      第81回日本癌学会学術総会
  • [学会発表] HPLMを用いた培養条件下での口腔癌細胞株の分子生物学的比較2022

    • 著者名/発表者名
      山口かれん, 山元智史, 中山淳, 山本雄介
    • 学会等名
      第81回日本癌学会学術総会
  • [学会発表] 溶骨性luminal乳がん細胞株の性状解析2022

    • 著者名/発表者名
      Yuxuan Han, 中山淳, 二口充, 伊藤恵美, 渡辺慎哉, 仙波憲太郎
    • 学会等名
      第81回日本癌学会学術総会
  • [学会発表] 乳がんにおけるアンドロゲン応答性の解析2022

    • 著者名/発表者名
      黒岩由佳, 伊藤景紀, 中山淳, 仙波憲太郎, 山本雄介
    • 学会等名
      第81回日本癌学会学術総会
  • [学会発表] Cell-in-Cell現象に着目した乳がん細胞株の性状解析2022

    • 著者名/発表者名
      林祐介, 中山淳, 仙波憲太郎, 山本雄介
    • 学会等名
      第81回日本癌学会学術総会
  • [学会発表] 同所性移植手法を用いたNMuMG-HOXB7細胞の転移能評価2022

    • 著者名/発表者名
      東和志, 中山淳, 仙波憲太郎
    • 学会等名
      文部科学省新学術領域研究学術研究支援基盤形成「先端モデル動物支援プラットフォーム」2022年度若手支援技術講習会
  • [学会発表] セリン代謝異常によるがん細胞特異的な細胞外小胞分泌の誘導とがん転移の亢進2022

    • 著者名/発表者名
      山元智史, 中山淳, 落谷孝広, 山本雄介
    • 学会等名
      文部科学省新学術領域研究学術研究支援基盤形成「先端モデル動物支援プラットフォーム」2022年度若手支援技術講習会
  • [学会発表] セリン代謝亢進による細胞外小胞の分泌異常と乳がん転移機構2022

    • 著者名/発表者名
      山元智史, 中山淳, 山本雄介, 落谷孝広
    • 学会等名
      第31回日本がん転移学会学術集会・総会
  • [学会発表] HIF1標的遺伝子によるがん再分類の検討2022

    • 著者名/発表者名
      中道和也, 中山淳, 仙波憲太郎
    • 学会等名
      第31回日本がん転移学会学術集会・総会
  • [学会発表] 同所性移植手法を用いたNMuMG-HOXB7細胞の転移能評価2022

    • 著者名/発表者名
      東和志, 中山淳, 仙波憲太郎
    • 学会等名
      第31回日本がん転移学会学術集会・総会
  • [学会発表] 同所性移植手法を用いたNMuMG-HOXB7細胞の転移能評価2022

    • 著者名/発表者名
      東和志, 中山淳, 仙波憲太郎
    • 学会等名
      第26回日本がん分子標的治療学会学術集会
  • [学会発表] FLT3陽性多発性骨髄腫を標的とした新規抗がん剤の合成と探索2022

    • 著者名/発表者名
      山元智史, 森屋亮平, 中山淳, 伊集院良祐, 青山洋史, 山本雄介
    • 学会等名
      第47回日本骨髄腫学会学術集会

URL: 

公開日: 2023-12-25  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi