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2021 年度 実績報告書

過冷却水中における協働的運動の支配因子:多自由度系における反応座標探索手法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 20J14619
研究機関大阪大学

研究代表者

菊辻 卓真  大阪大学, 基礎工学研究科, 特別研究員(DC2)

研究期間 (年度) 2020-04-24 – 2022-03-31
キーワードソフトマター物理 / 計算科学 / 水素結合 / 過冷却水
研究実績の概要

過冷却水中で引き起こされる、水素結合破断に伴う水分子間の協働的運動を明らかにするために、3つの研究を行なった。
(1)過冷却水中での水素結合破断に伴う多体構造間の構造変化を理解するために、マルコフ状態間モデルを用いることで、水分子3分子間で引き起こされるアクセプター切り替え運動に伴う3分子間の構造および周囲の水素結合本数の変化を解析した。この研究により深い過冷却状態では水素結合ネットワークに沿って引き起こされるが顕著となることを明らかにした。
(2)過冷却水中でみられるケージ効果を理解するために、水素結合ネットワークのダイナミクスを基準に分子の運動をケージに囚われた状態とケージから解放された状態に分割を行なった。さらに連続時間型ランダムウォークモデルに則り、ケージの時間に対する特性を求め、全体の運動性との間を形式化した。これにより分子レベルの局所的な構造変化から、全体の運動性が示す過冷却水中での複雑な温度依存性を解明した。
(3) 分子動力学計算で得られた状態間での遷移確率の結果と分子構造の関係を深層学習により求め、説明可能AIを利用することで、遷移を決定する分子構造の抽出を行なった。深層学習を利用することで、過冷却水中での水素結合破断のように多くの分子を伴う運動についても、その遷移を支配する構造の特定が期待される。
この3つの研究結果についてそれぞれまとめ、論文として発表・発表準備中である。

現在までの達成度 (段落)

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2021

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] Transition pathway of hydrogen bond switching in supercooled water analyzed by the Markov state model2021

    • 著者名/発表者名
      Takuma Kikutsuji, Kang Kim, Nobuyuki Matubayasi
    • 雑誌名

      The Journal of Chemical Physics

      巻: 154 ページ: 234501

    • DOI

      10.1063/5.0055531

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Breakdown of the Stokes-Einstein relation in supercooled liquids: A cage-jump perspective2021

    • 著者名/発表者名
      Raffaele Pastore, Takuma Kikutsuji, Francesco Rusciano, Nobuyuki Matubayasi, Kang Kim, Francesco Greco
    • 雑誌名

      The Journal of Chemical Physics

      巻: 155 ページ: 114503

    • DOI

      10.1063/5.0059622

  • [学会発表] 過冷却水中での水素結合破断に伴う多体構造変化:マルコフプロセスで記述する遷移ネットワーク2021

    • 著者名/発表者名
      菊辻卓真,金鋼,松林伸幸
    • 学会等名
      第23理論化学討論会
  • [学会発表] ケージ・ジャンプでモデル化される拡散係数と構造緩和時間2021

    • 著者名/発表者名
      菊辻卓真,金鋼, F. RusianoA, R. PastoreA, F. GrecoA, 松林伸幸
    • 学会等名
      第35回分子シミュレーション討論会

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公開日: 2022-12-28  

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