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2021 年度 実施状況報告書

酵母に発現させた3重らせん型ランダムペプチドライブラリからの創薬リードの探索

研究課題

研究課題/領域番号 20K05756
研究機関早稲田大学

研究代表者

増田 亮  早稲田大学, 理工学術院, 次席研究員(研究院講師) (90632159)

研究分担者 小出 隆規  早稲田大学, 理工学術院, 教授 (70322253)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
キーワード3重らせんペプチド / コラーゲン
研究実績の概要

ペプチドは標的分子に対して高い親和性と特異性で結合することができる。3重らせんペプチドはプロテアーゼによる分解に強く抵抗し、血管内投与後にも特定の臓器に集積することなく排泄される。したがって、生物活性を有する3重らせんペプチドは医薬品リードとして有望である。生物活性を有するペプチドを探索するための有力な一つの方法として、ランダムな配列を有するペプチドのライブラリを構築することが挙げられる。申請者はこれまでに3重らせんペプチドのランダムライブラリを構築した。さらに、そこからタンパク質に結合するペプチドを選択する手法を確立した。
これまでに数種類のコラーゲン結合性タンパク質(PEDF,HSP47,von Willebrand因子)に対して結合するペプチドの選択を行ない、複数の新規の結合ペプチドを取得した。これらに関しては酵母内で標的に対する結合の再現性を確認した。それとともに、該当配列を有するペプチドを化学合成し、in vitroでそれらの結合親和性と特異性を評価した。その結果、コラーゲン上に存在する天然の結合配列よりも高い標的特異性を有するペプチドが取得されたことが示唆された。さらに、これまでに結合ペプチドのセレクションが未実施であったその他のコラーゲン結合性タンパク質に対しても、これまでと同様のセレクションを行った。その結果、その内のいくつかのタンパク質で新規の結合ペプチドの候補を得ることができた。
一方でコラーゲン様3重らせんと類似の構造を認識するタンパク質複数種に対して結合する3重らせんペプチドの探索に挑戦したが、これらは取得することができなかった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

コラーゲン結合性タンパク質に対しては新規の結合候補となる3重らせんペプチドを取得することができたが、その生物活性の評価までには至らなかった。
また、コラーゲン様3重らせんと類似の構造を認識するタンパク質に対しては取得することができなかった。

今後の研究の推進方策

コラーゲン結合性タンパク質に対しては新規の結合候補となる3重らせんペプチドに関しては生物活性を評価するためのアッセイ系の構築を行い、それらの生物活性を評価する。
コラーゲン様3重らせんと類似の構造を認識するタンパク質に対しては、それらの結晶構造を基に酵母内に発現させるペプチドのデザインを改良したライブラリを構築する。それらのライブラリをもちいて、標的タンパク質に結合する3重らせんペプチドの取得を目指す。

次年度使用額が生じた理由

セレクションによって取得できたペプチドが少なかったため、その活性評価や解析にかかる研究費が想定よりも少なかったため。翌年度分は規模を拡大したセレクションを実施する。

  • 研究成果

    (2件)

すべて 2022 2021

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] The Thermal Stability of the Collagen Triple Helix Is Tuned According to the Environmental Temperature.2022

    • 著者名/発表者名
      K.K. Fujii, Y. Taga, Y.K. Takagi, R. Masuda, S. Hattori, T. Koide
    • 雑誌名

      Int. J. Mol. Sci.

      巻: 23 ページ: 2040

    • DOI

      10.3390/ijms23042040

    • 査読あり
  • [学会発表] A METHOD FOR OBTAINING PROTEIN-BINDING PEPTIDES FROM A RANDOM TRIPLE-HELICAL PEPTIDE LIBRARY2021

    • 著者名/発表者名
      Ryo Masuda, Khine Phyu Phyu Thant, Tetsuya Kadonosono, Takaki Koide
    • 学会等名
      第58回ペプチド討論会

URL: 

公開日: 2022-12-28  

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