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2022 年度 研究成果報告書

日本トキ集団の遺伝的多様性の評価・管理システムの構築

研究課題

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研究課題/領域番号 20K06377
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分42010:動物生産科学関連
研究機関京都大学

研究代表者

谷口 幸雄  京都大学, 農学研究科, 准教授 (10252496)

研究分担者 山田 宜永  新潟大学, 自然科学系, 教授 (40253207)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
キーワード希少動物の保全 / 遺伝的多様性 / トキ / ゲノム / DNA多型マーカー / 主要組織適合遺伝子複合体 / 次世代シーケンサー / multiplex-PCR
研究成果の概要

希少動物トキの保全においては、集団の遺伝的多様性の維持が求められる。本研究では、ゲノム情報を利用した日本トキ集団の遺伝的多様性の評価法の開発を進めた。はじめに、次世代シークエンサー(NGS)を利用した手法により、2018年に導入された新規始祖2個体に特異的なDNAマーカーを検出した。また、免疫応答に重要な主要組織適合遺伝子複合体(MHC)領域の多様性の解析では、始祖個体群7羽(従来の5羽と新規2羽)の持つMHC領域のハプロタイプが5種類であることを明らかにした。さらに、272個のDNAマーカーとMHC領域遺伝子型を同時にタイピングするmultiplex-PCR/NGS法をおおよそ確立した。

自由記述の分野

分子遺伝学

研究成果の学術的意義や社会的意義

日本トキ集団の遺伝的多様性を維持するためには、ゲノム情報を利用した遺伝的管理が求められる。250以上のDNA多型マーカーを判定する新たな手法の樹立は、個体識別や親子判定を可能にするのに加え、集団の遺伝的多様性を維持する交配計画の策定や野外へ再導入する個体の選定にも有用な情報を提供すると期待される。

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公開日: 2024-01-30  

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