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2023 年度 実績報告書

In situエピジェネティクス:分化・発生のH3K27me3機能解析の新戦略

研究課題

研究課題/領域番号 20K06449
研究機関順天堂大学

研究代表者

新井 大祐  順天堂大学, 医学部, 助教 (20624951)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2024-03-31
キーワードエピジェネティクス / エピゲノム編集 / ノックイン
研究実績の概要

本研究では「ゲノム上の特定の領域のH3K27me3の機能解析(in situエピジェネティクス)」の手法を確立し、細胞分化に伴うNodal遺伝子のH3K27me3による制御機構の解明を目指している。これまでに下記の成果を得た。
1. in situ H3K27me3調節ツールとしてPRC2の構成因子であるEZH2、EED、JARID2などをdCas9を融合したエピゲノム編集ベクターを作製した。これをES細胞に一過的に導入し、Nodal遺伝子に対するsgRNAとともに発現させてNodal遺伝子のmRNA発現への影響を調べたところ、抑制効果は認められなかった。一方、dCas9-KRABとの共発現では弱い抑制効果が5日間持続した。転写活性状態にある遺伝子をPRC2単独で十分に抑制することはできないと考えられた。酵素の組合せによる相乗効果を狙い、他のH3K27関連酵素(JMJD3、P300、DNMT3L)のエピゲノム編集ベクターも作製し、検討を進めている。
2. ES細胞に対し、非特異的な挿入を抑制しつつ高効率にHDR両アリルノックインする新手法(BiPoD法)を確立した。本法の工夫によりROSA26領域に異なる配列をヘテロで同時挿入することができるようになった。
3. H3K27me3とPRC2自身のどちらが機能に必要なのかを調べるために、H3K27me3の機能とPRC2の非触媒性の機能を独立にON・OFF可能なES細胞(PRC2スイッチES細胞)の作出を進めた。AID(Auxin inducible degron)タグのノックインにより内在性EZH2タンパク質が1時間以内に分解可能であることを確認した。さらにOsTIR(F74G)の発現カセットと酵素活性を持たないEZH2変異体のTet-ON発現カセットをROSA26領域にノックイン導入したES細胞株を樹立した。

  • 研究成果

    (1件)

すべて 2023

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件)

  • [雑誌論文] Generation and characterization of a human iPSC line (JUFMDOi007-A) from a patient with Usher syndrome due to mutation in USH2A2023

    • 著者名/発表者名
      Ukaji Takao、Takahashi-Shibata Mikako、Arai Daisuke、Tsutsumi Harumi、Tajima Shori、Akamatsu Wado、Matsumoto Fumihiko、Ikeda Katsuhisa、Usami Shin-ichi、Kamiya Kazusaku
    • 雑誌名

      Stem Cell Research

      巻: 69 ページ: 103100~103100

    • DOI

      10.1016/j.scr.2023.103100

    • 査読あり / オープンアクセス

URL: 

公開日: 2024-12-25  

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