研究課題
解糖系の第6ステップとして機能するグリセルアルデヒド3リン酸脱水素酵素(GAPDH)は通常はその酵素機能に集中しているが、細胞が酸化ストレスにさらされると、核やミトコンドリアに移行してアポトーシスを引き起こす。その他、相互作用する分子が数十種類知られており、このように機能を変える蛋白質のひとつとして moon-lighting protein と呼ばれている。GAPDH が機能を変える仕組みとして、そのホモ四量体が開裂して二量体や単量体になることが示唆されているが、実際にそれが in-vitro で実証されているわけではない。そこで、筆者は溶液条件を変えても相互作用を容易に検出できる NMR を用いてこれを解析した。まず、過酸化水素などの酸化条件下におくと、立体構造が壊れ凝集が起こることが分かった。アポトーシスが開始される引き金として活性システイン残基のニトロシル化が報告されているが、筆者の NMR の結果では、ニトロシル化による構造の大きな変化は見られなかった。構造変化には、活性システイン残基だけでなく、その他いくつかの残基の酸化が同時に必要であると考えられる。また、補酵素である NAD を外すと変性温度が下がるなど非常に不安定になるが、還元剤を入れるなど慎重に扱えばホモ四量体は維持されたままであった。なお、ここに ATP を加えると低温変性が起こり、二量体や単量体が分析ゲル濾過で検出された。これは温度を上げると再び四量体に戻るなど可逆的であった。以上の結果は、相互作用時にサブユニットが開裂するかどうかの証拠を与えたわけではないが、細胞内には 5 mM もの豊富な ATP が存在することを考えると、ATP との相互作用が、GAPDH の構造平衡において別機能を引き起こすほどのモル比に偏らせるのではないかと考えている。
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Biomol. NMR Assign.
巻: 18 ページ: 59-63
10.1007/s12104-024-10168-4
Structure
巻: 32 ページ: 352-361.e5
10.1016/j.str.2023.12.008
Protein Sci.
巻: 33 ページ: e5002
10.1002/pro.5002
巻: 33 ページ: e4994
10.1002/pro.4994
J. Magn. Reson.
巻: 352 ページ: 107489
10.1016/j.jmr.2023.107489
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
巻: 120 ページ: e2304103120
10.1073/pnas.2304103120
NMR学会誌
巻: 13 ページ: 32-40