研究成果の概要 |
TGFβは腫瘍抑制・促進作用の二面性を持つ増殖因子である。cis-NATsは、センス鎖と同領域から転写される逆方向の転写産物である。本提案では、TGFβ応答遺伝子のcis-NATsを網羅的に探索し、その生理的機能・分子機構の解明を試みた。本研究では独自プログラムCCIVRを開発し、機能的なTGFβ応答性cis-NATsを複数同定した(Ohhata T et al., 2022)。さらに非オーバーラップ型のアンチセンスRNAも探索できるCCIVR2を開発した(Suzuki M et al., 2023)。CCIVR/CCIVR2はアンチセンスRNA研究発展の寄与が期待できる。
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研究成果の学術的意義や社会的意義 |
cis-NATsは、センス鎖と同領域から転写される逆方向の転写産物である。本研究では、RNA-seqデータから網羅的にcis-NATsを同定できる独自プログラムCCIVRを開発した(Ohhata T et al., Sci Rep., 2022)。さらに非オーバーラップ型のアンチセンスRNAも探索できるCCIVR2も開発した(Suzuki M et al., Sci Rep., 2023)。CCIVR/CCIVR2は異なる生物種や多くの生物学的プロセスの機能的アンチセンス転写産物の解析に寄与する。
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