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2021 年度 実施状況報告書

細胞内グルタミンセンサーは ”特異的で弱い結合” をどのように達成しているのか

研究課題

研究課題/領域番号 20K06555
研究機関浜松医科大学

研究代表者

谷川 美頼  浜松医科大学, 医学部, 特任助教 (50553658)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
キーワードアミノ酸 / センサー / ラパマイシン / TORC1
研究実績の概要

細胞内グルタミンセンサーであるPib2は、mMレベルの高濃度グルタミン存在時にTORC1と結合しTORC1の活性化を引き起こす。Pib2がグルタミン依存的にどのようにTORC1を活性化するのかを明らかにするために以下の解析を行った。
(1) TORC1-Pib2の構造解析
Pib2を大腸菌から組換えタンパク質として精製することを試みているが、Pib2は天然変性領域からなるため分解凝集をおこしやすく難航している。C末端両側にエピトープタグを付加することにより分解を受けていないPib2を高純度で精製することができたが、Pib2はC末端側に1アミノ酸が付加されるだけでTORC1活性化能を失った。したがってPib2のC末端側からの精製ではTORC1活性化能を有したPib2は精製できないことがわかった。そこで酵母にTORC1-Pib2キメラを発現させ精製した。この精製キメラTORC1はグルタミン添加により試験管内で活性化される。このキメラTORC1のグルタミンにより引き起こされる構造変化をクロスリンクMS解析により明らかにしようと試みた。その結果、グルタミンによりキメラ内で架橋されるペプチドに変化がみられた。現在この結果の再現性を確認している。
(2) Pib2の天然変性領域(IDR)欠失変異体の解析
IDRの段階的欠失変異体のTORC1活性化能をモニターした。その結果、N末端側半分のIDRと、Eモチーフとtailモチーフ間のIDRの一部はTORC1活性化能を抑制していることが明らかになった。この領域は近縁種のオルソログでも天然変性領域であることが配列より予測されるが、アミノ酸配列の相同性はみられない。このことより、Pib2のIDRはTORC1内の特定の分子との結合を通じてPib2の活性を抑制しているのではなく、IDRのゆらぎが活性を抑制している可能性が示された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

Pib2が天然変性タンパク質であり精製が困難であるために研究が難航している。

今後の研究の推進方策

Pib2がどのようにTORC1と結合し、TORC1がそれによりどのように構造変化し活性化するのかをPib2-TORC1キメラタンパク質のクロスリンクMS、およびクライオ電顕による構造解析により明らかにしたい。

次年度使用額が生じた理由

コロナウィルスの影響により当該研究の補助を行うアルバイトの雇用を断念し、その費用を翌年度分とした。本年度はアルバイトを雇用する予定である。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2022 2021

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] A glutamine sensor that directly activates TORC12021

    • 著者名/発表者名
      Tanigawa Mirai、Yamamoto Katsuyoshi、Nagatoishi Satoru、Nagata Koji、Noshiro Daisuke、Noda Nobuo N.、Tsumoto Kouhei、Maeda Tatsuya
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 4 ページ: 1093

    • DOI

      10.1038/s42003-021-02625-w

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] TORC1-Gtr経路の新規上流因子の同定を目指したスクリーニング2022

    • 著者名/発表者名
      谷川美頼、外山美奈、前田達哉
    • 学会等名
      日本農芸化学会 2022年度大会
  • [学会発表] Pib2 is a glutamine sensor that directly activates TORC                           that directly activates TORC12021

    • 著者名/発表者名
      谷川美頼 、山本 勝良 、長門石 曉 、津本 浩平、能代 大輔 、 野田 展生、永田 宏次 、前田 達哉
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
  • [学会発表] RNAヘリカーゼDed1, Dbp1によるTORC1活性制御機構の解析2021

    • 著者名/発表者名
      谷川美頼、亀井理恵、館川宏之、前田達哉
    • 学会等名
      酵母遺伝学フォーラム第54回研究報告会

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公開日: 2022-12-28  

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