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2022 年度 実績報告書

CRISPRゲノムワイドスクリーニングによるマクロピノサイトーシス制御因子の同定

研究課題

研究課題/領域番号 20K06636
研究機関東京大学

研究代表者

坂巻 純一  東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 特任助教 (10825938)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
キーワードマクロピノサイトーシス / CRISPR-Cas9 / ユビキチン
研究実績の概要

マクロピノサイトーシスは細胞膜のラメリポディアの伸長と退縮により、細胞外液とそこに含まれる高分子を細胞内に取り込み、リソソームで分解する機構である。本研究計画では、マクロピノサイトーシス制御遺伝子を網羅的に同定するために、CRISPR-Cas9システムを用いたゲノムワイドスクリーニングを行った。期待されていたマクロピノサイトーシス不全細胞集団が得られなかったため、オルガネラ動態の新規制御因子の探索を目的として、膜のユビキチン修飾に焦点を当てて解析を行った。オルガネラ膜を構成するリン脂質であるホスファチジルエタノールアミン(PE)がユビキチン化されることを発見した。PEユビキチン化はエンドソームやリソソームなどのオルガネラや一部のウイルスで見られた。この修飾はタンパク質ユビキチン化と同様の反応によって触媒されており、出芽酵母ではユビキチン活性化酵素Uba1、ユビキチン結合酵素Ubc4/5、ユビキチンリガーゼTul1が一連の反応を担う。PEと結合したユビキチンは、脱ユビキチン化酵素Doa4により除去されるか、液胞へ運ばれて分解される。PEユビキチン化は膜の変形や切断に関与するESCRT複合体をエンドソーム膜に引き寄せ、エンドソーム内腔に小胞が形成する過程(腔内小胞形成)に関わる可能性が示唆された。さらに、ユビキチンファミリーのNEDD8やISG15もリン脂質と共有結合することが明らかになった。以上、オルガネラ膜を構成するリン脂質そのものがユビキチン化されることが示され、リン脂質との共有結合はユビキチンファミリーが持つ一般的な特徴であることが示唆された(Sakamaki J et al. Mol Cell 2022)。

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 3件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Protocol to purify and detect ubiquitinated phospholipids in budding yeast and human cell lines2023

    • 著者名/発表者名
      Sakamaki Jun-ichi、Mizushima Noboru
    • 雑誌名

      STAR Protocols

      巻: 4 ページ: 101935~101935

    • DOI

      10.1016/j.xpro.2022.101935

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The pH-sensing Rim101 pathway regulates cell size in budding yeast2023

    • 著者名/発表者名
      Shimasawa Masaru、Sakamaki Jun-ichi、Maeda Tatsuya、Mizushima Noboru
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 299 ページ: 102973~102973

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2023.102973

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Cell biology of protein?lipid conjugation2023

    • 著者名/発表者名
      Sakamaki Jun-ichi、Mizushima Noboru
    • 雑誌名

      Cell Structure and Function

      巻: - ページ: -

    • DOI

      10.1247/csf.23016

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 細胞小器官の膜リン脂質のユビキチン化2023

    • 著者名/発表者名
      坂巻純一、水島昇
    • 雑誌名

      実験医学 2023年 2月号

      巻: 41 ページ: 437~

    • DOI

      10.18958/7189-00003-0000377-00

  • [雑誌論文] Ubiquitination of phosphatidylethanolamine in organellar membranes2022

    • 著者名/発表者名
      Sakamaki Jun-ichi、Ode Koji L.、Kurikawa Yoshitaka、Ueda Hiroki R.、Yamamoto Hayashi、Mizushima Noboru
    • 雑誌名

      Molecular Cell

      巻: 82 ページ: 3677~3692.e11

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2022.08.008

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Conjugation of the ubiquitin family proteins to phospholipids2022

    • 著者名/発表者名
      Sakamaki Jun-Ichi、Mizushima Noboru
    • 雑誌名

      Autophagy

      巻: 19 ページ: 1361~1362

    • DOI

      10.1080/15548627.2022.2123637

    • 査読あり
  • [学会発表] Ubiquitination of phosphatidylethanolamine in organellar membranes2022

    • 著者名/発表者名
      Jun-ichi Sakamaki, Koji L. Ode, Yoshitaka Kurikawa, Hiroki R. Ueda, Hayashi Yamamoto, Noboru Mizushima
    • 学会等名
      The 23rd TMIMS International Symposium on "New Frontiers in Ubiquitin Proteasome System"
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Ubiquitination of phosphatidylethanolamine in organellar membranes2022

    • 著者名/発表者名
      Jun-ichi Sakamaki, Koji L. Ode, Yoshitaka Kurikawa, Hiroki R. Ueda, Hayashi Yamamoto, Noboru Mizushima
    • 学会等名
      The international symposium in Tokyo 2022 "Ubiquitin New Frontier: from Neo-Biology to Targeted Protein Degradation"
    • 国際学会
  • [学会発表] Ubiquitination of phosphatidylethanolamine in organellar membranes2022

    • 著者名/発表者名
      Jun-ichi Sakamaki, Koji L. Ode, Yoshitaka Kurikawa, Hiroki R. Ueda, Hayashi Yamamoto, Noboru Mizushima
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会大会
  • [学会発表] オルガネラ膜脂質ホスファチジルエタノールアミンのユビキチン化2022

    • 著者名/発表者名
      坂巻純一、大出晃士、栗川義峻、上田泰己、山本林、水島昇
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
  • [学会発表] Ubiquitination of phosphatidylethanolamine in organellar membranes2022

    • 著者名/発表者名
      Jun-ichi Sakamaki, Koji L. Ode, Yoshitaka Kurikawa, Hiroki R. Ueda, Hayashi Yamamoto, Noboru Mizushima
    • 学会等名
      The 8th International Symposium on Autophagy
    • 国際学会
  • [学会発表] オルガネラ膜脂質ホスファチジルエタノールアミンのユビキチン化2022

    • 著者名/発表者名
      坂巻純一、大出晃士、栗川義峻、上田泰己、山本林、水島昇
    • 学会等名
      第33回高遠分子細胞生物学シンポジウム
  • [学会発表] オルガネラ膜脂質ホスファチジルエタノールアミンのユビキチン化2022

    • 著者名/発表者名
      坂巻純一、大出晃士、栗川義峻、上田泰己、山本林、水島昇
    • 学会等名
      第74回日本細胞生物学会大会
  • [学会発表] Ubiquitination of phosphatidylethanolamine in organellar membranes2022

    • 著者名/発表者名
      坂巻純一、大出晃士、栗川義峻、上田泰己、山本林、水島昇
    • 学会等名
      第21回東京大学生命科学シンポジウム

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公開日: 2023-12-25  

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