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2022 年度 実績報告書

哺乳類ゲノムに内在化したレトロウイルス由来の遺伝子の進化メカニズムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 20K06775
研究機関東海大学

研究代表者

中川 草  東海大学, 医学部, 准教授 (70510014)

研究分担者 坂口 翔一  大阪医科薬科大学, 医学部, 助教 (20815279)
宮沢 孝幸  京都大学, ウイルス・再生医科学研究所, 准教授 (80282705)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
キーワード内在性レトロウイルス / 新規遺伝子 / レトロトランスポゾン / 膜タンパク質 / 膜融合 / 進化モデル
研究実績の概要

ウイルスゲノムが宿主ゲノムに水平伝播した配列(内在性ウイルス配列)が、宿主で機能遺伝子となった場合の進化の解明を行った。具体的には胎盤発生に重要な機能を果たすレトロウイルスの膜タンパク質由来の遺伝子を中心に解析した。レトロウイルスの膜タンパク質由来の遺伝子Syncytin-2はヒトを含めた旧世界ザルや新世界ザルにも共有される胎盤発生に寄与する遺伝子であると考えられていた。我々は新世界ザルのSyncytin-2の融合活性はヒトのものと比較して非常に弱いことを発見し、またいくつかの新世界ザルではナンセンス変異が入っているものを見つけた。したがって、Syncytin-2は新世界ザルのいくつかの種では胎盤発生に関与しているかもしれないが、別な膜タンパク質に由来するような遺伝子を独自に獲得している可能性があることを示した(Shoji et al. FEBS Open Bio 2023)。また、膜融合能をもつレトロウイルス由来の膜タンパク質が胎盤発生に寄与することが、さまざまな哺乳類、また胎盤様組織を持つ爬虫類でも示される。一方で、卵生の哺乳類である単孔類では、カモノハシでは膜タンパク質由来の配列が極めて少なかったために、胎盤を持たないことと関連があるのではないかと考えていた。近年、もう一種の単孔類であるハリモグラのゲノムが解読され、それらを合わせて解析した結果、ハリモグラのゲノムには400アミノ酸以上コードしている膜タンパク質由来の配列が121以上も存在することが分かった。また、そのうちの一つが膜融合能を持つことを実験的に証明した。胎盤という新奇形質の獲得と膜融合活性をもつウイルス由来の配列の獲得というのは単純な因果関係ではなく、必要条件なのかもしれないが、少なくとも十分条件ではないことを明らかにした(Kitao et al. MBE 2023)。

  • 研究成果

    (12件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Potentially reduced fusogenicity of syncytin‐2 in New World monkeys2023

    • 著者名/発表者名
      Shoji Hiyori、Kitao Koichi、Miyazawa Takayuki、Nakagawa So
    • 雑誌名

      FEBS Open Bio

      巻: 13 ページ: 459~467

    • DOI

      10.1002/2211-5463.13555

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dynamic evolution of retroviral envelope genes in egg-laying mammalian genomes2023

    • 著者名/発表者名
      Kitao Koichi、Shoji Hiyori、Miyazawa Takayuki、Nakagawa So
    • 雑誌名

      Molecular Biology and Evolution

      巻: - ページ: -

    • DOI

      10.1093/molbev/msad090

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Convergent evolution of antiviral machinery derived from endogenous retrovirus truncated envelope genes in multiple species2022

    • 著者名/発表者名
      Miyake Ariko、Ngo Minh Ha、Wulandari Shelly、Shimojima Masayuki、Nakagawa So、Kawasaki Junna、Nishigaki Kazuo
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 119 ページ: e2114441119

    • DOI

      10.1073/pnas.2114441119

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Monotreme-specific conserved putative proteins derived from retroviral reverse transcriptase2022

    • 著者名/発表者名
      Kitao Koichi、Miyazawa Takayuki、Nakagawa So
    • 雑誌名

      Virus Evolution

      巻: 8 ページ: veac084

    • DOI

      10.1093/ve/veac084

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Identification of conserved endogenous retroviral genes in monotremes (egg-laying mammals)2022

    • 著者名/発表者名
      Koichi Kitao, Takayuki Miyazawa, So Nakagawa
    • 学会等名
      ISEGB2022
    • 国際学会
  • [学会発表] 筋細胞の融合にかかわる内在性レトロウイルス由来の新規遺伝子2022

    • 著者名/発表者名
      上田真保子、小野悠介、隅山健太、三橋里美、三橋弘明、中川草
    • 学会等名
      日本進化学会年大会 第24回沼津大会
  • [学会発表] 単孔類ハリモグラのゲノムにみられるレトロウイルスの活発な内在化2022

    • 著者名/発表者名
      北尾晃一、早川卓志、宮沢孝幸、中川草
    • 学会等名
      日本進化学会年大会 第24回沼津大会
  • [学会発表] 新世界ザルで明らかになった syncytin 遺伝子の機能多様性とウイルス由来遺伝子の進化モデルの構築2022

    • 著者名/発表者名
      庄司日和、北尾晃一、宮沢孝幸、中川草
    • 学会等名
      日本遺伝学会第94回大会
  • [学会発表] Open reading frameが保存されたLINEレトロトランスポゾン座位の同定2022

    • 著者名/発表者名
      北尾晃一、宮沢孝幸、中川草
    • 学会等名
      日本遺伝学会第94回大会
  • [学会発表] Endogenous retroviruses in egg-laying mammals and the fusogenic property of an envelope protein in echidna2022

    • 著者名/発表者名
      Koichi Kitao, Shoji Hiyori, Takayuki Miyazawa, So Nakagawa
    • 学会等名
      6th Uppsala Transposon Symposium
    • 国際学会
  • [学会発表] 大規模シークエンスデータ解析が明らかにするRNAウイルスの生態系2022

    • 著者名/発表者名
      中川草
    • 学会等名
      日本微生物生態学会 第35回大会
    • 招待講演
  • [学会発表] 卵生哺乳類ゲノムに内在化したレトロウイルス由来のエンベロープタンパク質の細胞融合活性2022

    • 著者名/発表者名
      北尾晃一、庄司日和、宮沢孝幸、中川草
    • 学会等名
      第45回 日本分子生物学会年会

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公開日: 2023-12-25  

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