研究課題/領域番号 |
20K06782
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研究機関 | 東北大学 |
研究代表者 |
田邉 晶史 東北大学, 生命科学研究科, 助教 (40549044)
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研究期間 (年度) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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キーワード | 環境DNA |
研究実績の概要 |
2020年度は実験室の環境整備を行い、採集した試料を迅速に、汚染を抑制して分析できるようになった。 環境DNA試料の採集も予定していたが、残念ながらCOVID-19禍のため長期・遠距離の出張を見送らざるを得ず、試料を得ることができなかった。このため、分析する試料がまだ手元に集まっていない。 研究の進捗を早めるため、調査対象とする河川を大きく絞り込むこととした。計画では全国の1級河川のうちできるだけ多くを調査する予定だったが、さらに半分ほどまで減らし、2021年度に迅速な調査を進められるように準備を進めた。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
4: 遅れている
理由
環境DNA試料の採集も予定していたが、残念ながらCOVID-19禍のため長期・遠距離の出張を見送らざるを得ず、試料を得ることができなかった。このため、分析する試料がまだ手元に集まっていない。
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今後の研究の推進方策 |
研究の進捗を早めるため、調査対象とする河川を大きく絞り込むこととした。計画では全国の1級河川のうちできるだけ多くを調査する予定だったが、さらに半分ほどまで減らし、短期間で調査と分析を行う。
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次年度使用額が生じた理由 |
環境DNA試料の採集旅行を予定していたが、残念ながらCOVID-19禍により長期・遠距離の出張を見送らざるを得なかったため。
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備考 |
メタバーコーディングデータ分析パイプラインClaidentを大幅に改訂し、様々な機能を追加した。これに伴い、分析手順が大きく変わったため、シミュレーションで作成したデータを分析する例を用意した。また、これに基づいて分析手順を解説した環境DNA学会での講演、および研究集会での講演の動画を公開した。
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