| 研究課題/領域番号 |
20K07462
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| 研究機関 | 三重大学 |
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研究代表者 |
金子 伊澄 三重大学, 医学系研究科, 助教 (20515720)
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| 研究期間 (年度) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| キーワード | マラリア |
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| 研究実績の概要 |
ChIP-seqによるAP2-G標的遺伝子のゲノムワイドな同定を行った。ChIP-seq にはGFP融合AP2-G発現原虫（AP2-Gの発現ピークである赤血球感染後約18時間の原虫）および抗GFP抗体を用いた。ChIP-seqは独立して2回実施し再現性を得ることができた。これにより1000以上のAP2-G binding siteを同定し、660個以上のAP2-G標的遺伝子を同定した。それら標的遺伝子の機能分類を行った。さらにAP2-Gの結合配列を解明する為に、これら標的遺伝子の上流域の配列解析を行った。その結果、AP2-Gが特異的に結合する6塩基配列を同定した。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
当初の計画通りChIP-seqによるAP2-G標的遺伝子のゲノムワイドな解析を行った。それによりAP2-G標的遺伝子およびAP2-Gが特異的に結合する配列を同定することができた。
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| 今後の研究の推進方策 |
今回同定したAP2-G標的遺伝子のノックアウト原虫およびGFP融合原虫を作成し、その表現型を解析しガメトサイト形成への影響を評価する。AP2-Gの標的遺伝子から転写のコアクチベーター（ヒストン修飾酵素複合体、メディエーター複合体、クロマチンリモデリング複合体など）の候補をすべてピックアップする。各遺伝子にGFPタグを付し核への局在を確認する。この原虫を用いてChIP-seqを実施し、そのピークの位置よりどの転写因子にリクルートされるかを解析する。
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