本研究では、核構造と結びついたゲノム構造・機能環境に着目し、核膜孔を構築する核膜孔複合体を介した、扁平上皮癌(SCC:Squamous Cell Carcinoma)特異的マスター転写因子(MTF: Master Transcription Factor)の発現が誘導され維持されるメカニズムを解明することを目的とした。 SCC特異的MTFであるTP63に注目し、TP63の発現を誘導するスーパーエンハンサー(SE)をDNA-FISH法可視化し、核内空間における局在解析を実施した。TP63を含めたいくつかのSEが核膜孔近傍に局在化することが明らかになった。このSEの局在化にはSE構成タンパク質とNUP153の弱い分子間相互作用が関わることを明らかにした。 この分子間相互作用を生化学的に検出するための方法(LAIP法)を考案し、LAIP法とMS解析を組み合わせることで、SE構成因子や核膜孔相互作用因子について完全プロファイリングを達成した。
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