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2022 年度 実施状況報告書

免疫チェックポイント阻害治療最適化のためのマイクロサテライト不安定性多様性の解明

研究課題

研究課題/領域番号 20K07711
研究機関独立行政法人国立病院機構(九州がんセンター臨床研究センター)

研究代表者

織田 信弥  独立行政法人国立病院機構(九州がんセンター臨床研究センター), その他部局等, 腫瘍遺伝学研究室長 (40333372)

研究分担者 江崎 泰斗  独立行政法人国立病院機構(九州がんセンター臨床研究センター), その他部局等, 消化管・腫瘍内科部長 (30463491)
瀧口 総一  独立行政法人国立病院機構(九州がんセンター臨床研究センター), その他部局等, 研究員(移行) (00280793) [辞退]
下川 元継  山口大学, 大学院医学系研究科, 教授 (10625966)
宮下 要  独立行政法人国立病院機構(九州がんセンター臨床研究センター), その他部局等, 外部連携研究者 (60544088)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2025-03-31
キーワードマイクロサテライト不安定性 / DNAミスマッチ修復 / DNAポリメラーゼ / 複製エラー / ゲノム不安定性 / 免疫チェックポイント阻害治療
研究実績の概要

マイクロサテライト不安定性(MSI)は免疫チェックポイント阻害薬(ICI)治療をはじめとするがん薬物法において極めて重要なバイオマーカーとみられているが、ヒト腫瘍におけるMSI形質は過単純視されており、現行のMSI解析法とMSI形質分類は不十分である。より正確に奏効する集団を同定するために、ヒト腫瘍におけるMSI形質の実態を明らかにし、DNAミスマッチ修復(MMR)異常との関係を明らかにする必要がある。本研究は、(a)正確な高精度マイクロサテライト解析を「核」として、これに(b)次世代型シーケンサーによるゲノム変異頻度解析を併せて行うことで、ヒト腫瘍におけるMSI形質多様性の実態を解明し、それぞれの形質とMMR異常との真の関係を明らかにすることを目的とした。本研究により、ICI治療をはじめとするがん薬物療法の真のバイオマーカーを明らかにし、治療戦略を適正化、最適化することが最終目的である。本研究では、i) 腫瘍患者より切除された組織標品を対象とした解析として、A. 高精度マイクロサテライト解析系によるマイクロサテライト変化の詳細な評価、B. MMR異常に関連する他の形質の評価を、またこれを受け、ii) ヒト腫瘍におけるマイクロサテライト不安定化形質多様性を解明し、iii) MMR異常と各形質との関係を明らかにすることを計画した。初年度に高精度マイクロサテライト解析系を精度検証し、改善した。第2年度は、症例を選定し、組織標品よりDNAを抽出した。第3年度は、これらのDNA標品と解析系を用い、マイクロサテライト不安定性を解析した。解析結果からは、広く認知されているマイクロサテライト不安定性形質とは異なる、より微細な変化が、薬剤治療の効果とよく相関することがわかってきた。MMR異常とマイクロサテライト不安定化形質との関係がこれまで過単純化されてきたことが、再確認された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

今年度の解析により、広く認知されているマイクロサテライト不安定性形質とは異なる、より微細な変化が、薬剤治療の効果とよく相関することが明らかになりつつある。フッ化ピリミジン治療を受けた患者コホートについては、すでに解析を終え、公表の準備をすすめている。また、ICI治療を受けた患者コホートについても、同様な結果が得られつつあり、解析をすすめている。

今後の研究の推進方策

残された解析をすすめる。ゲノム変異頻度とマイクロサテライト不安定化形質との関係については、保険診療で提供されるがんゲノムプロファイリング検査をすでに受けた症例において、腫瘍細胞のマイクロサテライトを解析するアプローチも検討したい。

次年度使用額が生じた理由

試薬その他の消耗品の価格、梱包単位等の都合で若干の残額が生じた。今後も効率よい使用に努める。

  • 研究成果

    (2件)

すべて 2022

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Activation of recombinational repair in Ewing sarcoma cells carrying EWS-FLI1 fusion gene by chromosome translocation2022

    • 著者名/発表者名
      Tanaka K, Suzuki K, Miyashita K, Wakasa K, Kawano M, Nakatsu Y, Tsumura H, Yoshida MA, Oda S
    • 雑誌名

      Sci Rep

      巻: 12 ページ: 14764, 1-12

    • DOI

      10.1038/s41598-022-19164-x

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 繰り返し塩基配列におけるDNAポリメラーゼの滑りダイナミクス - マイクロサテライトPCR増幅産物の高精度解析から2022

    • 著者名/発表者名
      塩井誠次郎、島本章義、中上裕有樹、下川元継、織田信弥
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会

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公開日: 2023-12-25  

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