2022 年度研究成果報告書

ロングリードシーケンサーを用いた神経筋疾患の原因探索と病態解明

研究課題

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研究課題/領域番号	20K07907
研究種目	基盤研究(C)
配分区分	基金
応募区分	一般
審査区分	小区分52020:神経内科学関連
研究機関	横浜市立大学
研究代表者	宮武聡子横浜市立大学, 附属病院, 准教授 (50637890)
研究期間 (年度)	2020-04-01 – 2023-03-31
キーワード	ロングリードシーケンサー / 神経筋疾患 / 脊髄小脳変性症 / リピート伸長病 / CANVAS / RFC1 / ナノポアシーケンス / ターゲットロングリードシーケンス法
研究成果の概要	本研究の成果として、①小脳性運動失調・ニューロパチー・前庭反射消失症候群(Cerebellar ataxia, neuropathy, vestibular areflexia syndrome; CANVAS）で、RFC1遺伝子の両アレル性リピート異常伸長の全配列を決定し、リピートユニットの組み合わせの多様性を発見した [Miyatake et al., Brain. 2022]。②リピート伸長病の原因となる病的リピート伸長を網羅的に一括スクリーニングできる迅速ロングリードシーケンス系を確立した[Miyatake et al., npj Genom. Med. 2022]。
自由記述の分野	神経遺伝学
研究成果の学術的意義や社会的意義	①は、ロングリードシーケンサーを用いて、リピート配列の全長を解読できたことが既存のゲノム手法の限界を打ち破る新たな学術的意義である。また配列パターンの組み合わせと臨床症状の関連を示唆する知見が得られたことは、疾患の病態解明の手掛かりになると考えている。 ②は、ナノポアシーケンサーのターゲットロングリードシーケンス法を利用したもので、従来のゲノム手法ではスクリーニングが困難であったリピート伸長病の簡便・迅速・正確な診断が可能となったことが有意義であり、臨床診療の診断精度向上に貢献できると考えている。