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2020 年度 実施状況報告書

難治性急性リンパ性白血病におけるクローン解析に基づく発症・再発様式の解明

研究課題

研究課題/領域番号 20K08723
研究機関独立行政法人国立病院機構(名古屋医療センター臨床研究センター)

研究代表者

真田 昌  独立行政法人国立病院機構(名古屋医療センター臨床研究センター), その他部局等, 高度診断研究部長 (20529044)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
キーワード急性リンパ性白血病 / 遺伝子再構成 / クローン変化 / 微小残存病変
研究実績の概要

JPLSG(日本小児白血病リンパ腫研究グループ)で乳児白血病を対象に行われたMLL-10研究登録例のうち、KMT2A(MLL)転座陽性例73例を対象に、MLLならびに転座partner遺伝子であるAF4,ENL,AF9の既知の切断点を網羅するようにイントロン領域も含め設計したcapture baitを用いた次世代シーケンサー(NGS)による配列決定を行い、切断点の同定を行った。その結果、62例(86%)において、ゲノム上の切断点が同定された。比較的稀なpartner遺伝子であったために、partner遺伝子側にベイトが設計されていない転座例においても、KMT2A側のベイトにより4例で切断点を捕捉可能であった。
ゲノム上の切断点に対して相補的なプライマーおよび蛍光プローブを作成し、定量PCRを用いて微小残存病変(MRD)の定量評価を行ったところ、54例で1×10e-4以下での高感度な測定が可能となり、免疫グロブリン遺伝子(IG)再構成でのMRD測定を組み合わせると、ほぼ全例でMRDの定量評価が可能となった。
MLL転座切断点およびIG再構成の両者でMRD評価可能であった測定結果を比較すると、1×10e-3よりも低いレベルでは定量結果の乖離がある症例があり、IG再構成ではMRDが消失しているにも関わらず、MLL切断点では陽性となる症例が散見された。臨床経過を比較するとMLL切断点でのMRD評価で陰性となった症例は、IG再構成で陰性となった症例に比し、再発率が低く、予後は良好であった。分子病態から考えてもMLL切断点を用いることで、より正確な残存腫瘍量を評価できていると考えられた。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

ターゲットキャプチャーシーケンスを用いたMLL切断点の同定は、ほぼ計画通りに完了している。臨床情報も入手済みであり、今後、並行して行っている免疫グロブリン遺伝子再構成による評価と合わせて、詳細なクローン構造の解析と臨床的意義について検討する予定である。

今後の研究の推進方策

ターゲットキャプチャーシーケンスを用いたMLL切断点の同定とゲノム上の切断点を標的とした微小残存病変評価系の有用性を明確とし、次期臨床試験での臨床応用を目指したい。
乳児ALL以外のMLL転座例については十分な検証ができておらず、今後、検体収集を積極的に進める必要がある。

次年度使用額が生じた理由

学会がWEB開催になり、コロナ禍に伴う物品の納入時期の遅れにより、残額が生じた。
納入待ち物品については、次年度納品のものもあり、次年度においては残額分も含め使用予定である。

  • 研究成果

    (11件)

すべて 2021 2020

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 6件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (4件) (うち招待講演 4件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Clinical characteristics and outcomes of B-ALL with ZNF384 rearrangements: a retrospective analysis by the Ponte di Legno Childhood ALL Working Group2021

    • 著者名/発表者名
      Hirabayashi S, et al, Sanada M, et al, Manabe A
    • 雑誌名

      Leukemia

      巻: 0 ページ: 0

    • DOI

      10.1038/s41375-021-01199-0

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Landscape of driver mutations and their clinical impacts in pediatric B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia2020

    • 著者名/発表者名
      Ueno H、Yoshida K、et al, 、Sanada M
    • 雑誌名

      Blood Advances

      巻: 4 ページ: 5165~5173

    • DOI

      10.1182/bloodadvances.2019001307

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] A risk-stratified therapy for infants with acute lymphoblastic leukemia: a report from the JPLSG MLL-10 trial2020

    • 著者名/発表者名
      Tomizawa D、Miyamura T、Imamura T、Watanabe T、Saito A、Ogawa A、Takahashi Y、Hirayama M、Taki T、Deguchi T、Hori T、Sanada M、Ohmori S、Haba M、Iguchi A、Arakawa Y、Koga Y、Manabe A、Horibe K、Ishii E、Koh K
    • 雑誌名

      Blood

      巻: 136 ページ: 1813~1823

    • DOI

      10.1182/blood.2019004741

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Panel?based next?generation sequencing facilitates the characterization of childhood acute myeloid leukemia in clinical settings2020

    • 著者名/発表者名
      Ishida Hisashi、Iguchi Akihiro、Aoe Michinori、Nishiuchi Ritsuo、Matsubara Takehiro、Keino Dai、Sanada Masashi、Shimada Akira
    • 雑誌名

      Biomedical Reports

      巻: 13 ページ: 1~1

    • DOI

      10.3892/br.2020.1353

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Clinical utility of target capture‐based panel sequencing in hematological malignancies: A multicenter feasibility study2020

    • 著者名/発表者名
      Yasuda Takahiko、Sanada Masashi、et al.
    • 雑誌名

      Cancer Science

      巻: 111 ページ: 3367~3378

    • DOI

      10.1111/cas.14552

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Genomic analysis of multiple myeloma using targeted capture sequencing in the Japanese cohort2020

    • 著者名/発表者名
      Kanamori Takashi、Sanada Masashi、et al.
    • 雑誌名

      British Journal of Haematology

      巻: 191 ページ: 755~763

    • DOI

      10.1111/bjh.16720

    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] MRD monitoring in ALL treatment2021

    • 著者名/発表者名
      真田 昌
    • 学会等名
      第18回日本臨床腫瘍学会学術集会
    • 招待講演
  • [学会発表] 造血器腫瘍の臨床現場におけるパネルシーケンスの有用性2020

    • 著者名/発表者名
      真田 昌
    • 学会等名
      第60回日本リンパ網内系学会総会
    • 招待講演
  • [学会発表] 成人Ph陰性ALL診療におけるMRD測定の意義2020

    • 著者名/発表者名
      真田 昌
    • 学会等名
      第82回日本血液学会学術集会
    • 招待講演
  • [学会発表] 小児AYA造血器腫瘍のゲノム医療2020

    • 著者名/発表者名
      真田 昌
    • 学会等名
      第58回日本癌治療学会学術集会
    • 招待講演
  • [図書] 白血病治療マニュアル(改訂第4版)2020

    • 著者名/発表者名
      宮脇 修一、中尾 眞二、清井 仁、宮本 敏浩、真田 昌(分担執筆)
    • 総ページ数
      366
    • 出版者
      南江堂
    • ISBN
      978-4-524-22664-1

URL: 

公開日: 2021-12-27  

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