| 研究課題/領域番号 |
20K09061
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| 研究機関 | 福島県立医科大学 |
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研究代表者 |
早瀬 傑 福島県立医科大学, 医学部, 助教 (00583387)
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| 研究分担者 |
岡山 洋和 福島県立医科大学, 医学部, 講師 (20583397)
坂本 渉 福島県立医科大学, 医学部, 講師 (40622337)
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| 研究期間 (年度) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| キーワード | 大腸癌 / CIN / MSS |
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| 研究実績の概要 |
大腸癌の多段階発癌に伴い、染色体不安定性(chromosomal instability: CIN)は増強し、またCINは癌進展を促進する。大腸癌の約15％がマイクロサテライト不安定性（microsatellite instability: MSI）を示すのに対し、残りの約85％はマイクロサテライト安定（microsatellite stable: MSS）であり典型的にはCINを示す。本課題は、CIN/MSSを示す約85%の大腸癌を対象に、腺腫形成・癌化・進展・転移過程で生じる染色体の欠失に着目する。CINを制御する遺伝子の不活化それ自体がCINのdriverとなり得るとも考えており、その同定と機能的検証、臨床的意義の解明を目的とする。bioinformaticsを用いた網羅的な遺伝子変異/コピー数 (増幅/欠失) /発現など多層データの統合解析と機能的検証を軸としており、癌進展の中心機構であるCINの理解と応用に知見をもたらすと考える。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
独自のbioinformaticsを応用し、複数データセットを用いて、網羅的プラットフォーム（マイクロアレイ、RNA-seq、コピー数解析、ゲノムシークエンス）を統合した候補遺伝子抽出を試みている。新規候補遺伝子は複数得られているが予備的解析段階である。
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| 今後の研究の推進方策 |
データ解析の継続とともに大腸癌細胞株を用いた検討に着手する。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
大規模な公開データを用いた解析が主体であったこと、当研究室ですでに確立した実験系が本研究の予備実験に流用可能であったことから、結果として新規の支出が抑えられた。次年度使用額は、主として消耗品費に充当する。
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