2021 年度実施状況報告書

大腸がんの治療耐性におけるKDM2Bの意義解明と新規治療法の開発

研究課題

研究課題/領域番号	20K09092
研究機関	千葉県がんセンター(研究所)
研究代表者	中村友紀千葉県がんセンター(研究所), がん予防センター腫瘍ゲノム研究室, 嘱託研究員 (50869287)
研究分担者	下里修千葉県がんセンター(研究所), がん予防センター腫瘍ゲノム研究室, 室長 (30344063) 石毛文隆千葉県がんセンター(研究所), 肝胆膵外科, 医員 (60815801)
研究期間 (年度)	2020-04-01 – 2023-03-31
キーワード	大腸がん / 治療耐性 / KDM2B / ヒストンメチル化
研究実績の概要	切除不能大腸がんの治療成績を改善するためには、その主な標準治療である化学療法に対する耐性の克服が重要課題である。申請者らの先行研究から、ヒストン脱メチル化酵素の一つであるKDM2Bが大腸がん患者の化学療法に対する抵抗性獲得にも寄与する可能性が示唆された。そこで本研究は、KDM2Bの大腸がん細胞の薬剤耐性における意義を探求し、KDM2Bを起点とするエピジェネティックな遺伝子発現の亢進および抑制の全体像を解明することを目的とする。今年度は、野生型KDM2B（以下、WTという）、あるいは酵素失活型の変異KDM2B（以下、MTという）を過剰発現する大腸がん細胞株を使ってChIP-seq解析を行い、KDM2Bが制御するH3K4me3修飾レベルをゲノムワイドに解析している。その成果の一部として、コントロール細胞に比べてWT発現細胞では、様々な遺伝子の転写開始点（TS）周辺におけるH3K4me3レベルが全体的に減少する傾向が観察されたが、MT発現細胞ではそれが見られなかった。そこで個々の遺伝子に関して詳細に検討すると、マイクロアレイ解析で同定されたKDM2Bが制御する候補遺伝子群のいくつかは、TS周辺のH3K4me3レベルが低下していたが、MT発現細胞ではそれが見られなかった。当該遺伝子はKDM2Bによって発現制御されている可能性が申請者らのこれまでの成果から示唆されており、KDM2Bにより遺伝子制御の解明につながると考えている。現在、DNA結合ドメインに変異を導入した新しい変異体を作製したので、これらと合わせてKDM2Bによる遺伝子制御の全容解明につなげたいと考える。
現在までの達成度 (区分)	現在までの達成度 (区分) 2: おおむね順調に進展している理由計画していた実験を概ね予定通りに実施し、一定の成果を得ることができている。
今後の研究の推進方策	抗がん剤暴露によるKDM2B発現低下の分子機構の解明。大腸がん細胞株（上記の初代細胞株も含む）におけるKDM2B遺伝子の転写開始点付近のヒストン修飾（H3K27Acなど）の程度を低濃度の抗がん剤暴露（5-FU）の有無で比較し、当該遺伝子の発現に対する影響を検討する。
次年度使用額が生じた理由	新型感染症対策が継続している状況の中で、計上していた海外を含めた学会発表ができなかったことが大きな原因と考える。また、海外から輸入される試薬について、入手が難しかった時期もあり、試薬の購入が滞ったとも考える。最終年度になるので、研究試薬の計画的な購入に加えて、成果発表としての国際学術雑誌への掲載を目指し、その掲載料に使用したいと考える。