| 研究課題/領域番号 |
20K09630
|
|---|
| 研究機関 | 国際医療福祉大学 |
|---|
研究代表者 |
片岡 史夫 国際医療福祉大学, 医学部, 准教授 (40306824)
|
|---|
| 研究分担者 |
赤羽 智子 慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 特任助教 (40398699)
平沢 晃 岡山大学, 医歯薬学総合研究科, 教授 (90296658)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2020-04-01 – 2024-03-31
|
| キーワード | 卵巣癌 |
|---|
| 研究実績の概要 |
本研究はプラチナ抵抗性卵巣癌に対するセカンドライン以降の治療薬剤の選択ツールをゲノム解析と薬剤感受性試験（DSRT）から確立することを目的としている。本年度は患者腹水検体と腫瘍組織における遺伝子特性を理解する目的で次世代シークエンサー解析を行った。卵巣癌例の手術時に腹水検体と腫瘍組織および正常コントロールのための血液検体をペアで採取し各検体由来のDNAを抽出した。抽出したDNAはQIAGEN社の275遺伝子が搭載されたがん関連網羅的遺伝子パネルを使用した解析のためのLibrary作成を行った。作成されたLibraryのクオリティーチェックを定量PCRにて確認し至適濃度に調整したのち、次世代シークエンサーMiseq Systemにて900 coverageにて稼働した。得られたFastQファイルはクラウド解析システムGene Groveにて遺伝子変異を抽出し、取得した変異データーがCOSMICおよび ClinVarの各データーベースにて病原性の可能性の高い遺伝子に該当したもののみを再抽出してアノテーションを行った。すべての解析は患者同意と倫理委員会の承認を得て行われた。その結果、腹水検体で検出された遺伝子変異は腫瘍組織とほぼ共通し、さらに腫瘍組織で検出されなかった病的変異も検出可能であった。今回の検討から、腹水検体由来のDNAはホルマリンでの固定による負荷がかからないことからDNAの状態が良好であり、臨床状況により複数回の検体採取も可能であることから治療時の患者状態の反映や薬剤奏功を推定する遺伝子変化を検出する有用なツールとなる可能性が考えられた。
|
| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
昨年度に予定していた次世代シークエンサー解析が実施可能であったことからおおむね順調と判断した。
|
| 今後の研究の推進方策 |
腫瘍病変の次世代シークエンサー解析を行いドライバージーンの検出を試み、薬剤感受性と遺伝子解析結果の比較を行う予定である。それにより、再発卵巣癌に対する薬剤感受性とゲノム変化の両側面からの解析に基づいた至適薬剤の選択法の確立を目指す。引き続き次世代シークエンサー解析を行う予定である。腹水検体由来のDNAは回収が少量の場合があり次世代シークエンサー用のLibrary作成が困難な場合があるが作成時の手技を解析に支障が生じない程度に改変することで解析可能としたい。
|
| 次年度使用額が生じた理由 |
コロナ感染拡大に伴い学会開催がWeb講演会が主体となったため旅費使用の必要性が生じなかったことから次年度使用額が生じた。また、本研究内容は次世代シークエンサー解析を実施するが、解析用検体の集積に時間を要しため、機器の稼働を次年度に持ち越したことから次年度使用額が生じた。今年度に、次世代シークエンサー解析に費用を充当する予定である。
|
