研究課題
基盤研究(C)
腸内細菌目細菌における主要な薬剤耐性菌におけるβ－ラクタマーゼはIncFプラスミド上に存在することが多い。臨床分離株のゲノム解析とゲノムデータの機械学習から薬剤耐性プラスミドと染色体との組みあわせが薬剤耐性遺伝子の保持に関与することが示唆された。染色体の遺伝的な性質とプラスミドの系統の総合的な解析により、優勢となる薬剤耐性菌の解明につながると期待される。
薬剤耐性菌
本研究により、プラスミドの系統解析が進み、薬剤耐性遺伝子は特定の系統に分類されるプラスミド上に多いことが明らかとなった。また、ゲノムデータの機械学習手法による解析に道筋を付けることに成功し、染色体の性質によって薬剤耐性プラスミドの保有頻度が決まることがゲノムデータから見いだされた。細菌のゲノム解析ではプラスミドと染色体の系統に着目することで、薬剤耐性菌として流行する潜在能力を推定するための基礎的知見が得られ、感染制御の一助となると期待される。
