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2021 年度 研究成果報告書

動的不均一場における膜蛋白質の複合体形成機構解明に向けた計算手法の開発

研究課題

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研究課題/領域番号 20K14432
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分13040:生物物理、化学物理およびソフトマターの物理関連
研究機関慶應義塾大学

研究代表者

山本 詠士  慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (00779340)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2022-03-31
キーワード不均一場 / 生体膜 / メゾスケール / 反応拡散方程式 / ブラウン動力学法
研究成果の概要

生体膜では,細胞の機能維持において重要な特定の脂質やタンパク質が集まることで,大きさが10~200 nmオーダーの動的かつ不均一なドメインが形成されることが知られているが,場の不均一性が場を拡散する生体分子挙動に与える影響は不明な点が多い.本研究では,反応拡散方程式とブラウン動力学法を組み合わせた2次元メゾスケールシミュレーション法の開発を行い,場の不均一性がそこを拡散する分子挙動に与える影響を明らかにした.

自由記述の分野

生物物理

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究では生体膜における場の不均一性の影響が顕著になる時空間スケールの現象をシミュレーションできる手法の開発を行うことで,生体分子挙動を扱える分子動力学シミュレーションと一分子計測実験の時空間分解能が交差するメゾスケールの現象を扱うことが可能となったことには学術的意義がある.今後,生体膜におけるタンパク質相互作用の破綻により生じる病理の解明に繋がることが期待されるため,社会的意義がある.

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公開日: 2023-01-30  

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