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2022 年度 実施状況報告書

海洋物質循環に大きな影響を与えるリザリア類の種組成・バイオマス解明

研究課題

研究課題/領域番号 20K15589
研究機関島根大学

研究代表者

仲村 康秀  島根大学, 学術研究院環境システム科学系, 特任助教 (70830735)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2024-03-31
キーワード放散虫 / ケルコゾア / ファエオダリア / DNAメタバーコーディング / 単細胞PCR / 単細胞動物プランクトン / 海洋生物 / バイオミネラリゼーション
研究実績の概要

環境DNAメタバーコーディングや生態系モデル等で海洋生態系の変化を観察する為には、各生物のDNA配列とバイオマスに関する情報が必要不可欠である。しかしながら、海洋生態系において高いバイオマスを持つ事が示唆されているリザリア類に関してはこれらの情報が欠落している為、従来の研究ではリザリア類を介した物質循環・食物網の経路が考慮されておらず、この経路の影響が過小評価されている可能性がある。以上の背景から、本研究では自然環境中におけるリザリア類の種多様性、分布およびバイオマスを解明する事を目的としている。

令和4年度には国内・海外における広範囲なフィールド調査を予定していたが、新型ウイルスの感染拡大により島根県・鳥取県のみでの調査を行った。前年度と同様に、宍道湖・中海にて、プランクトンの種組成を毎月定点観測した。宍道湖・中海や過去に北半球から得られた水試料に対してDNAメタバーコーディングを行い、(リザリア類を含む)プランクトン組成の季節変化と分布を明らかにした。このようにして得られた成果について2本の原著論文(共著)を執筆・公表し、また国内外の各学会にて公表した。

リザリア類の分布と生態を解明するため、過去に撮影された水中カメラ画像を解析し、リザリア類が微小な甲殻類と共生関係を築く現象(通称「リザリアライダー現象」)を解明し、リザリア類が家畜的に甲殻類に利用されている可能性を見出した。このデータについて1本の原著論文(共著)を執筆・公表した。
また、リザリア類に対するこれまでの研究が評価され、日本原生生物学会から奨励賞を授与された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

フィールドにおける定点観測等により、リザリア類の分布とバイオマスの解明については明らかになりつつあり、原著論文や学会発表等で成果を公表し始めている。また、リザリア類の生態に関しては、水中カメラ画像の解析から新たな知見が得られ、こちらについても原著論文等で成果を公表している。以上の事から、本研究は現在まで順調に進展していると言える。

今後の研究の推進方策

令和5年度は引き続き島根県内などでフィールド調査を行う予定である。水中画像データの解析をさらに進めて、リザリア類の生態と分布に関する原著論文を執筆する。さらに、水・堆積物試料に対して、次世代シークエンサーによるDNAメタバーコーディングを行い、様々な環境に生息するリザリア類の分布と種多様性に関する論文を執筆する。研究成果は3つの国内学会 (プランクトン学会、海洋学会および原生生物学会)、1つの国際学会 (JpGU) にて公表する予定である。

次年度使用額が生じた理由

リザリア類の種同定のため令和4年度内にDNA分析を行う予定であったが、一部の試料について結果が不十分であった(得られたDNA配列の質が悪かった)為、計画を変更して再度DNA分析を行うこととしたため、次年度使用額が生じた。

  • 研究成果

    (24件)

すべて 2023 2022 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 1件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (15件) (うち国際学会 3件、 招待講演 4件) 図書 (1件)

  • [国際共同研究] University of Ulsan(韓国)

    • 国名
      韓国
    • 外国機関名
      University of Ulsan
  • [国際共同研究] CICIMAR(メキシコ)

    • 国名
      メキシコ
    • 外国機関名
      CICIMAR
  • [雑誌論文] Community structure and diversity of five groups of zooplankton in the Perdido region of the Gulf of Mexico using DNA metabarcoding2023

    • 著者名/発表者名
      Gasca-Pineda Jaime、Galindo-S?nchez Clara E.、Martinez-Mercado Miguel A.、Jim?nez-Rosenberg Sylvia P. A.、Hereu Clara Mar?a、Nakamura Yasuhide、Herzka Sharon Z.、Compaire Jesus C.、Gomez-Reyes Ricardo、Robles-Flores Javier、Saavedra-Flores Anaid、Arteaga Maria Clara
    • 雑誌名

      Aquatic Ecology

      巻: 57 ページ: 149-164

    • DOI

      10.1007/s10452-022-10002-w

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] DNA metabarcoding reveals vertical variation and hidden diversity of Alveolata and Rhizaria communities in the western North Pacific2022

    • 著者名/発表者名
      Sogawa Sayaka、Nakamura Yasuhide、Nagai Satoshi、Nishi Noriko、Hidaka Kiyotaka、Shimizu Yugo、Setou Takashi
    • 雑誌名

      Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers

      巻: 183 ページ: 103765~103765

    • DOI

      10.1016/j.dsr.2022.103765

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evaluation of Acid-Lugol’s Solution for Preservation of Acantharia (Radiolaria)2022

    • 著者名/発表者名
      Takano Emiko、Nakamura Yasuhide、Takahashi Kazutaka
    • 雑誌名

      Thalassas: An International Journal of Marine Sciences

      巻: 38 ページ: 939~945

    • DOI

      10.1007/s41208-022-00439-z

    • 査読あり
  • [雑誌論文] First record of the maternal care behavior of a “rhizarian rider,”<i>Phronimopsis spinifera</i> Claus, 1879 (Amphipoda, Hyperiidea), in association with <i>Aulosphaera</i> sp. (Rhizaria, Cercozoa, Phaeodaria, Aulosphaeridae)2022

    • 著者名/発表者名
      Saito Nobuhiro、Kayama Aiko、Nakamura Yasuhide
    • 雑誌名

      Crustacean Research

      巻: 51 ページ: 111~113

    • DOI

      10.18353/crustacea.51.0_111

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 「第8回日本プランクトン学会若手の会」開催報告2022

    • 著者名/発表者名
      小原静夏・風間健宏・岸正敏・鈴木健太郎・土屋健司・戸篠祥・仲村康秀・山田和正
    • 雑誌名

      日本プランクトン学会報

      巻: 69 ページ: 62~63

    • DOI

      10.24763/bpsj.69.1_62

  • [雑誌論文] 単細胞動物プランクトン(ファエオダリア類・放散虫類)の生態・系統分類に関するフィールド研究2022

    • 著者名/発表者名
      仲村康秀
    • 雑誌名

      原生生物

      巻: 5 ページ: 5-5

  • [学会発表] ファエオダリア類(単細胞動物プランクトン)の生活史と「リザリアライダー現象」2023

    • 著者名/発表者名
      仲村康秀、齋藤暢宏、加山藍子、堀利栄
    • 学会等名
      汽水域合同研究発表会2023
  • [学会発表] DNAメタバーコーディングを用いた宍道湖過去2000年間の環境変化解明2023

    • 著者名/発表者名
      仲村康秀
    • 学会等名
      第263回遺伝子機能解析部門セミナー・第387回細胞工学研究会講演会
    • 招待講演
  • [学会発表] 浮遊性有孔虫-藻類共生系の特異性と進化2023

    • 著者名/発表者名
      高木悠花、仲村康秀、齊藤宏明
    • 学会等名
      海洋生物シンポジウム2023
  • [学会発表] 単細胞動物プランクトン(ファエオダリア類)の生活史解明と「リザリアライダー」現象2023

    • 著者名/発表者名
      仲村康秀、齋藤暢宏、加山藍子、堀利栄
    • 学会等名
      海洋生物シンポジウム2023
  • [学会発表] 若手から見たプランクトン学会:課題と今後の展望について2023

    • 著者名/発表者名
      仲村康秀
    • 学会等名
      日本プランクトン学会70周年記念シンポジウム プランクトン学会の過去、現在、未来
    • 招待講演
  • [学会発表] DNA metabarcoding focused on plankton as an effective approach for the reconstruction of past environment.2022

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, Y., Kajita, H., Maeda, A., Seto, K., Ando, T., Katsuki, K., Saito, Y., Ogiso-Tanaka, E.
    • 学会等名
      JpGU
    • 国際学会
  • [学会発表] Novel discovery of sensory cells and organelles from oceanic detritivorous calanoids: Ultrastructure and presumed functions2022

    • 著者名/発表者名
      Komeda, S., Nakamura, Y., Tuji, A., Tokuhiro, K., Yoshida, M., Ohtsuka, S.
    • 学会等名
      e-ICOC
    • 国際学会
  • [学会発表] Reconstruction of paleo-environment using the DNA metabarcoding on plankton: A case study in Lake Shinji, Japan.2022

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, Y.
    • 学会等名
      EsReC-SKLEC-NIGLAS joint seminar on estuarine and paleoenvironmental research
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 単細胞動物プランクトン (放散虫類・フェオダリア類) の多様性解明と今後の展望2022

    • 著者名/発表者名
      仲村康秀、池上隆仁、木元 克典
    • 学会等名
      海洋生物シンポジウム2022
  • [学会発表] 相模湾におけるコロダリア目放散虫類の鉛直分布2022

    • 著者名/発表者名
      小平岳、仲村康秀、鈴木紀毅、菊池知彦、下出信次
    • 学会等名
      海洋生物シンポジウム2022
  • [学会発表] 現生浮遊性有孔虫と共生藻のパートナーシップ2022

    • 著者名/発表者名
      高木悠花、仲村康秀、齊藤宏明
    • 学会等名
      日本古生物学会2022年年会
  • [学会発表] 現生放散虫類・フェオダリア類の系統分類と生態:新知見と今後の展望2022

    • 著者名/発表者名
      仲村康秀、池上隆仁、鈴木紀毅、辻彰洋、木元克典、高橋 一生
    • 学会等名
      第15回放散虫研究集会
  • [学会発表] ファエオダリア類・放散虫類の生態・系統分類に関するフィールド研究2022

    • 著者名/発表者名
      仲村康秀
    • 学会等名
      第55回 日本原生生物学会大会
    • 招待講演
  • [学会発表] 堆積物コア調査と定期モニタリングとを組み合わせた古生態系復元2022

    • 著者名/発表者名
      仲村康秀、小木曽映里、瀬戸浩二、安藤卓人、香月興太、齋藤文紀
    • 学会等名
      2022年日本プランクトン学会・日本ベントス学会合同大会
  • [学会発表] クロシオアミダマの骨格構造解析2022

    • 著者名/発表者名
      山口桃佳、仲村康秀、緒明祐哉、下出信次、今井宏明
    • 学会等名
      第17回バイオミネラリゼーションワークショップ
  • [図書] 古生物学の百科事典2023

    • 著者名/発表者名
      日本古生物学会、西 弘嗣
    • 総ページ数
      790
    • 出版者
      丸善出版
    • ISBN
      4621307584

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公開日: 2023-12-25  

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