| 研究課題/領域番号 |
20K15784
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| 研究機関 | 国立研究開発法人産業技術総合研究所 |
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研究代表者 |
曽 超 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 産総研特別研究員 (80822460)
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| 研究期間 (年度) |
2020-04-01 – 2022-03-31
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| キーワード | GCR / RNA degradation / Genetic compensation |
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| 研究実績の概要 |
今年度は、RNA-seqデータ（RNA分解因子のノックダウンとコントロール）と遺伝子配列情報を用いて、GCR関連遺伝子ペアの予測と既知GCR関連遺伝子ペアでの検証をした。それに、初めてヒトゲノムから130ペアのGCR関連遺伝子候補の抽出ができた。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
ヒトHeLa細胞株から130ペアのGCR関連遺伝子候補の抽出ができた。現在、GCR関連遺伝子とクロマチンの相互作用に関して調査中である。
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| 今後の研究の推進方策 |
公開されたRNA-DNA相互作用データ(DRIP, DRIPc, iMARGI, REDなど)から、GCR関連遺伝子とクロマチンの直接相互作用に関して調査する。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
当初、令和２年度計画では、GCR関連遺伝子ペアの検証を行うにあたり、大規模な実験データの解析を行う予定であった。しかし、研究過程で公開された実験データの取得と整理は予想以上の時間がかかるため、データ解析用の計算機購入費用を計上する。また，国内外の学会参加費も支出予定である。
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