列島日本人形成の解明：旧石器時代人のゲノム分析

2022 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 20K15884
• 研究種目: 若手研究
• 配分区分: 基金
• 審査区分: 小区分45050:自然人類学関連
• 研究機関: 東邦大学
• 研究代表者: 水野 文月 東邦大学, 医学部, 講師 (50735496)
• 研究期間 (年度): 2020-04-01 – 2023-03-31
• キーワード: 列島日本人 / 古代ゲノム / 旧石器時代 / 性別判定

研究成果の概要

旧石器時代人、早期ならびに前期縄文時代人のミトコンドリアゲノムの全長配列を解読した。得られたすべての縄文時代人ミトコンドリアＤＮＡ配列は現代日本人配列クラスターに含まれ、縄文時代人と現代日本人の間では連続性が見られた。一方、港川人のもつ配列を直接的な祖先とする現代人は存在せず、港川人から現代日本人への直線的連続性は見られなかった。なお、予想以上に港川人のDNA保存状態は厳しく、系統解析をするに十分な核ゲノムデータ量は得られなかったが、一定量以上の次世代シーケンス・リード配列は得られた。そこで、確度の高い性別判定方法を新たに開発し、港川1号は男性であるとのゲノム判定結果を得た。

自由記述の分野

古代ゲノム

研究成果の学術的意義や社会的意義

出アフリカを果たした現代型ホモサピエンスが日本列島に到達したのは数万年前の後期旧石器時代であるが、酸性土壌が多い日本列島では骨などが残り難いだけでなく、人骨に残されたＤＮＡへのダメージも大きい。このため、日本列島旧石器時代人骨のゲノム情報は皆無であったが、本研究によって、そのミトコンドリアゲノムの全長配列解読が初めて成し遂げられた。また、一定量以上の次世代シーケンス・リード配列が得られたことで、ゲノム情報に基づく性別判定も成し遂げられた。これは、“最初の列島日本人”である旧石器時代人の全ゲノム解明への第一歩となる成果であり、列島日本人を体系的に理解するための始点に到達した学術的意義は大きい。