| 研究実績の概要 |
最終年度は肺小細胞癌の細胞株を用いたATAC-seqと、及びUT&Tag（H3K4me3, H3K27ac, H3K27me3）を行い、統合的エピゲノム解析を行うことでそれぞれのサブタイプ（ASCL1型、NEUROD1型、POU2F3型）を定義した。次にATAC-seqからのMotif enrichment解析、H3K27acのCUT&Tagからスーパーエンハンサー解析を行い、ELF3がASCL1型肺小細胞癌においてスーパーエンハンサー関連転写因子として機能していることが分かってきた。さらに抗ELF3特異的抗体を用いてCUT&Tagを行ったところ、ゲノムワイドにELF3のbinding領域を同定するに成功した。
次にsiRNAを用いてELF3のknockdownを行い、RNA-seqによるトランスクリプトーム解析を行った。前述のELF3のbinding領域の情報と統合しELF3によって制御される遺伝子200個程度を同定することができた。Pathway解析等により、これらの遺伝子群は細胞周期や生存にかかわっていることが分かり、一方で神経内分泌分化への関与少ないことも分かってきた。以上の結果よりELF3はASCL1型肺小細胞癌ではスーパーエンハンサー関連転写因子として腫瘍促進的な効果を持つことが示唆された。ELF3は膀胱癌や十二指腸癌ではがん抑制遺伝子として働いており、がん抑制・促進の２面性を持つ転写因子であることが分かった。
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