| 研究課題/領域番号 |
20K16559
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| 研究機関 | 杏林大学 |
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研究代表者 |
三好 佐和子 杏林大学, 医学部, 助教 (90846817)
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| 研究期間 (年度) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| キーワード | 口腔内微生物叢 / Microbiome解析 / 生活習慣病 / 人間ドック / 唾液 |
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| 研究実績の概要 |
体内微生物叢（microbiota）と代謝性疾患を含む様々な病態との関連が報告されている。その中でも、特に口腔内、唾液は採取の簡便性から臨床利用に適している。本研究では、一般人口であり、かつ詳細な臨床データを有する人間ドック受診者を対象に、唾液内の細菌のみならず真菌、ウイルスを含む微生物構成ならびに機能の両面から包括的にmicrobiome解析を行い、代謝性疾患との関連を評価し、早期の疾患マーカー、モニタリングツールとしての有用性を検討することを目的としている。
研究開始の2020年度は、新型コロナウイルス感染拡大に伴い、研究対象となる人間ドックは一時休止、受診制限をおこなっており、リクルート予定であった定期受診者についてもキャンセル、受診スケジュールの変更が多かった。そのため、予定していた参加登録が見込めず、1年間の遅れが生じた。その間、研究協力体制の構築、環境の整備、所属機関の倫理委員会への申請を終え、唾液検体からのＤＮＡ抽出、シーケンシング解析についての予備検討を行った。予備検討において、唾液抽出ＤＮＡでは、唾液中消化酵素等の影響により、口腔内細菌のPolymerase Chain Reaction法での検出は難渋したため、抽出法の慎重な条件検討を行った。
2021年度から人間ドック受診者数は比較的回復したため、参加登録を開始した。現在、予備検討で得られた条件を用い、回収した唾液検体のDNA抽出、臨床情報の収集を行っている。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
研究開始予定であった2020年度は、新型コロナウイルス感染拡大に伴い、研究対象となる人間ドックを一時休止、受診制限をおこなっており、リクルート予定であった定期受診者についてもキャンセル、受診スケジュールの変更が多かった。そのため、予定していた参加登録が見込めず、1年間の遅れが生じた。その間、研究環境の整備、実験手技、最適な唾液ＤＮＡ抽出条件の検討を行った。
2021年度からは人間ドック受診者数も比較的回復したため、研究参加のリクルートを開始した。同時に唾液、臨床情報の収集を行い、唾液サンプルからのＤＮＡ抽出も並行して行っている。
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| 今後の研究の推進方策 |
引き続き研究参加者のリクルートを進め、予備検討の結果に基づいてサンプル処理を継続する。2022年度に初回採取サンプルに関して、16s rRNA amplicon sequencing解析を行い、健常群、代謝性疾患予備群、代謝性疾患群の微生物構成を比較解析する。Keyとなる微生物群を検出し、それらのMetagenomic shotgun sequencingデータを用い、機能解析を行う。
また、予定していた微生物構成の経時的変化、代謝性疾患の推移との関連を評価するため、補助事業期間延長申請を行いつつ、2023年度には再受診者からの唾液サンプルを用い、16s rRNA amplicon sequencing解析、機能解析を行い、検討する。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
前年度からの使用額が利用可能であり、当年度でその一部を利用したが、次年度使用額が生じている。2021年度中途から研究参加者リクルートを開始しており、年度内のサンプルのみではシーケンシング解析には不十分であったため、当年度はDNA抽出のみを行い、16s rRNA amplicon sequencing解析、機能解析は2022年度に延期とした。使用期限のある採取キット、各種試薬についても2021年度から2022年度にかけての購入予定と変更した。
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