2022 年度研究成果報告書

術後肝内再発抑制法開発に向けた肝癌幹細胞特異的なHLA抗原ペプチドの同定

研究課題

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研究課題/領域番号	20K17619
研究種目	若手研究
配分区分	基金
審査区分	小区分55020:消化器外科学関連
研究機関	山口大学
研究代表者	兼清信介山口大学, 医学部, 特別医学研究員 (80555730)
研究期間 (年度)	2020-04-01 – 2023-03-31
キーワード	癌
研究成果の概要	抗ヒトHLA*A24:02抗体を用いて作製したセファロースビーズカラムでの免疫沈降により濃縮したペプチドを質量分析による網羅的解析 (peptidome解析) を細胞株ライセートおよび臨床サンプルを用いて行った。得られたペプチド配列とそのペプチドを含むタンパクをコードするmRNA発現との関連を検討した結果、mRNA発現が高い産物はコンセンサス配列と相同であった。条件検討を重ねた結果、陽イオン交換にSCXカラムを用いることでペプチド同定数を向上させることに成功した。これによりFDR<5%の9-merペプチドを1000近く同定でき、その大部分はHLA結合コンセンサス配列を示すものであった。
自由記述の分野	消化器外科
研究成果の学術的意義や社会的意義	がん細胞上でのHLA拘束ペプチドの配列同定は、オーダーメイド癌免疫療法の実現に向けて学術的・社会的に意義がある。本研究によって、peptideome解析 (がん組織と抗HLA抗体を用いた免疫沈降物の質量分析) の感度を向上させることができた。得られたペプチド配列を検討した結果、HLA拘束ペプチドはコンセンサス配列との相同性を示し、元となるタンパクをコードするmRNAレベルでは高い発現を示した。これらの結果から、プロテオミクスではなく次世代シーケンサーを用いた解析データのみでも、個々の症例に応じたHLA拘束ペプチドの配列を予測できることが示唆された。