研究課題
若手研究
本研究では,胃癌,食道癌などの消化器癌を対象として,ユビキチン修飾系異常を介した癌の進展機序を包括的解明を目的とする.食道癌細胞株(TE-6,TE-8)における遺伝子発現を確認したところ,細胞株間でもheterogeneityが非常に大きいことが確認された.そのため当初予定していたbulkでの解析から,単一細胞由来の遺伝子発現解析に基づいた機序解明が必要と考えた.既存のsingle cell RNA-seqの工程に,タンパク質分解およびなり,cDNA合成が可能となることが確認できた.
上部消化器癌
当初の目的とは異なる結果となったが, FFPE標本からの微量解析が可能となる兆候が発見されたことは非常に社会的意義のあることと考える. 本手法を本格的に検討することで, あらゆる疾患分野で画期的なブレイクスルーが得られる可能性や、従来の固定標本からの検査の精度をさらに上昇させることも可能と考える.