| 研究課題/領域番号 |
20K18099
|
|---|
| 研究機関 | 岩手医科大学 |
|---|
研究代表者 |
前川 滋克 岩手医科大学, 医学部, 助教 (40774039)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2020-04-01 – 2023-03-31
|
| キーワード | 陰茎癌 / ゲノム / ヒトパピローマウイルス |
|---|
| 研究実績の概要 |
陰茎癌2例とそれに対応する症例の正常検体からそれぞれDNAを抽出し、全ゲノムシークエンスを行った。その結果、同じ1塩基を解読した重複回数、いわゆるdepthは陰茎癌検体で54.95、正常組織で57.39と解析には十分な結果が得られた。陰茎癌2例のゲノム異常は81103個みつかり、1例当たりでは43416個と37687個であった。そのうちタンパク質コード領域内の異常は306個（1例当たり201個および105個）であった。
その内訳は、アミノ酸配列が異なる1塩基置換は181個（123個、58個）、アミノ酸配列に変化のない1塩基置換は77個（49個、28個）、フレームシフトが起こる塩基の挿入が2個（1個、1個）、フレームシフトが起こる欠失が2個（2個、0個）、フレームシフトが起こらない欠失が4個（3個、1個）、ストップコドンに変わる変化が5個（5個、0個）であった。
ゲノム構造異常は275か所でみつかり、1症例当たり182、93か所であった。ゲノム構造異常とは、ゲノム上の塩基配列が数100から数1000万塩基にわたって、通常2コピーある配列が1コピーになったり（コピー数異常）、別の染色体部位に位置が変わったり（転座）、方向が入れ替わったり（逆位）など、大きく塩基配列が変化する異常のことである。ゲノム構造異常のうち、欠失が91か所（1例当たり43か所、48か所）、逆位が16か所（12か所、4か所）、重複が84か所（67か所、17か所）、転座が84か所（60か所と24か所）でそれぞれ認められた。
陰茎癌の発症に関わることが古くから知られているヒトパピローマウイルス（HPV）の検出を試みたところ、遺伝子変異が少なかった後者の症例にのみ認められ、HPVの挿入部位はKLF5という遺伝子の上流であった。
|
| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
陰茎癌は非常にまれな癌であり、岩手医科大学で手術を行うのは例年では1年間で0-1例である。今回、科研費若手研究の助成をいただき、陰茎癌の研究を始めるにあたり、2020年度は岩手医科大学泌尿器科学講座の関連全施設に陰茎癌症例を紹介依頼をし、定期的に連絡し依頼を重ねた。その結果、2020年の1年間で6例の陰茎癌を手術し検体を得られた。
|
| 今後の研究の推進方策 |
10例集まったところで理化学研究所に全ゲノムシークエンスを行っていただく予定となっている。2021年度中には解析が行えると考えている。
|
| 次年度使用額が生じた理由 |
物品購入にあたりアカデミック版にすることや複数社への見積もりで安く購入するなど対策したことにより次年度繰り越しが35,900円分発生した。次年度もより安く購入していき予定していた以上の実験消耗品を購入し繰り越し分も使用するつもりである。
|
