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2022 年度 実施状況報告書

Radiogenomicsのための動的心臓形状・ゲノム・生活習慣情報モデリング

研究課題

研究課題/領域番号 20K19924
研究機関九州大学

研究代表者

宮内 翔子  九州大学, システム情報科学研究院, 助教 (40828555)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2024-03-31
キーワード心臓MRI / 遺伝子情報 / 虚血性心疾患診断支援システム
研究実績の概要

拍動による形状変形を伴う心臓を対象として,動的な3次元形状情報とゲノム情報および生活習慣の関連性について分析することで,radiogenomicsのための相関モデルの構築を目指し,研究を進めている.
前年度までに,UK Biobankから心臓MRI・ゲノム情報および生活習慣等の患者メタデータの取得を行った.さらに,4次元の心臓MRI情報を低次元空間に圧縮し,心臓の動的形状情報として抽出するための深層学習モデルを構築した.
2022年度は,これらを用いて,心臓の動的形状情報とメタデータを入力とする,虚血性心疾患診断支援システムの構築を行った.本支援システムは,生成モデルとMultilayer perceptronを組み合わせることで構築されており,疾患の診断に寄与している心臓の解剖学的特徴を,圧縮前の元の空間で可視化することが可能である.200名分(虚血性心疾患患者100名,健常者100名)のデータセットを用いた実験を通して,心臓の動的情報もしくは生活習慣情報等の患者メタデータのみを入力として用いる場合よりも,2つの情報を同時に入力した場合に診断精度が向上することを確認した.この研究成果は,国内の研究会にて発表済みである.
さらに,構築したシステムを,ゲノム情報も入力として扱えるよう拡張し,ゲノム情報を入力情報として追加することで,診断精度が向上することを確認した.本研究成果は,2023年度国際学会にて発表予定(採択済み)である.

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

動的な3次元形状情報とゲノム情報および生活習慣を入力として用いた診断支援システムの構築が完了し,国内研究会での発表も実施できたため.また,拡張したシステムの研究成果についても,国際学会での発表が決定しているため.

今後の研究の推進方策

動的な3次元形状情報とゲノム情報および生活習慣を同時に入力する診断支援システムは構築できたものの,依然として診断精度に問題がある.さらなる診断精度向上のために,より動的3次元形状情報やゲノム情報の特性を捉えた特徴量抽出が行えるよう,システムの構造を改良する予定である.また,心電図など,他の患者情報の追加も検討する予定である.

次年度使用額が生じた理由

国内学会にオンラインにて参加したため,使用した旅費が想定よりも少なくなった.次年度国際学会にオンサイトで参加予定であり,航空券の価格が予想よりも高騰しているため,旅費として使用予定である.

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2023 2022 その他

すべて 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件) 備考 (1件)

  • [学会発表] Diagnostic support system for coronary artery disease using dynamic heart shapes and metadata2023

    • 著者名/発表者名
      Shunsuke Takashima, Shoko Miyauchi, Ken’ichi Morooka, and Ryo Kurazume
    • 学会等名
      Computer Assisted Radiology and Surgery 37th International Congress and Exhibition
    • 国際学会
  • [学会発表] 患者の心臓動的形状とメタデータを用いた虚血性心疾患診断システムの構築2022

    • 著者名/発表者名
      宮内 翔子, 諸岡 健一, 倉爪 亮
    • 学会等名
      電子情報通信学会 医用画像研究会
  • [学会発表] 3次元心臓モデルのためのフレーム補間手法の構築2022

    • 著者名/発表者名
      チャン チュジェ, 宮内 翔子, 諸岡 健一,倉爪 亮
    • 学会等名
      コンピュータビジョンとイメージメディア研究会
  • [学会発表] 脳内部組織からの距離場とActive Appearance Modelによる患者脳内部構造の推定2022

    • 著者名/発表者名
      宮内 翔子, 渡邊 匠吾, 宮城 靖, 諸岡 健一
    • 学会等名
      第25回 画像の認識・理解シンポジウム
  • [備考] 研究者の研究成果を記載したwebページ

    • URL

      http://fortune.ait.kyushu-u.ac.jp/~miyauchi/

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公開日: 2023-12-25  

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