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2017 年度 実績報告書

代数計算と数値計算の融合を戦略とする医薬品候補物の副作用予測モデルの創造への挑戦

研究課題

研究課題/領域番号 17H06198
配分区分補助金
研究機関大阪大学

研究代表者

日比 孝之  大阪大学, 情報科学研究科, 教授 (80181113)

研究分担者 高木 達也  大阪大学, 薬学研究科, 教授 (80144517)
研究期間 (年度) 2017-06-30 – 2022-03-31
キーワード代数計算 / 数値計算 / 医薬品候補化合物 / 分子記述子 / 最尤推定
研究実績の概要

医薬品候補化合物とは、動物実験通過後の臨床試験開始前の化合物のことである。医薬品候補化合物が、人体に発症させる重篤な副作用は、臨床経験上、その種類が限られる。化学物質の構造は、炭素原子の個数、水素原子の個数、二重結合の個数、ベンゼン環の個数、体積、表面積、分子量などの分子記述子と呼ばれる「変数」を使って表現される。重篤な副作用を y_1, . . . , y_s とし、分子記述子を x_1, . . . , x_N とする。副作用 y_j の発症確率を q_j とする。変数 x_i の函数 f_{ij} を
f_{ij}(x_i) = 1 / (1 + exp({\alpha_{ij}x_i}))
と定義する。「第一次予測モデル」は、記述子層と副作用層から成る階層型モデルと副作用層における相互結合型モデルの融合モデルである。すなわち、医薬品候補化合物の分子記述子 x = (x_i) と副作用が発症する確率 q = (q_j) は、関係式
\sum_{1 \leq k \leq s}\gamma_{jk}q_{k} = \sum_{1 \leq i \leq N}\beta_{ij}f_{ij}(x_i), 1 \leq j \leq s,
を満たす。但し、\beta_{ij} と \gamma_{jk}=\gamma_{kj} は定数、\gamma_{jj}=1 である。研究のハイライトは、最尤推定の観点から N 行 s 列の行列 β=(\beta_{ij}) と s 次対称行列 γ=(\gamm a_{ij}) を計算することである。 平成29年度は、薬学の観点から、重篤な副作用を、スティーヴンスジョンソン症候群、横紋筋融解症、白質脳症、悪性症候群、中毒性表皮壊死症、QT延長症候群、可逆後白質脳症症候群の7種類に絞り、その基礎データを準備した。

現在までの達成度
現在までの達成度

2: おおむね順調に進展している

理由

本挑戦的研究(開拓)の目的は、医薬品候補化合物の副作用発症確率を予測する数理モデルの創造をマイルストーンに掲げ、斬新な代数計算と既存の数値計算との融合理論を開拓し、将来の研究のプロトタイプを提示することである。平成 29 年度は研究の初年度であり、研究期間も短いが、その礎となる研究に着手することができたことを考慮すると、おおむね順調に進展していると判断することができる。

今後の研究の推進方策

「第一次予測モデル」の N 行 s 列の行列 β=(\beta_{ij}) と s 次対称行列 γ=(\gamm a_{ij}) の計算に挑戦し、「第一次予測モデル」の妥当性を検証する。

  • 研究成果

    (1件)

すべて 2017

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件)

  • [雑誌論文] Pfaffian systems of A-hypergeometric equations I: bases of twisted cohomology groups2017

    • 著者名/発表者名
      Takayuki Hibi, Kenta Nishiyama, Nobuki Takayama
    • 雑誌名

      Advances in Mathematics

      巻: 306 ページ: 303--327

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.aim.2016.10.021

    • 査読あり

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公開日: 2019-12-27   更新日: 2020-07-30  

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