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2020 年度 実施状況報告書

高強度テラヘルツ光が誘起するタンパク質構造変換に基づくゲノム機能制御技術の開発

研究課題

研究課題/領域番号 20K21261
研究機関東北大学

研究代表者

原田 昌彦  東北大学, 農学研究科, 教授 (70218642)

研究分担者 保科 宏道  国立研究開発法人理化学研究所, 光量子工学研究センター, 上級研究員 (10419004)
研究期間 (年度) 2020-07-30 – 2022-03-31
キーワードテラヘルツ光 / 核内アクチン / クロマチン
研究実績の概要

細胞核内でゲノムはヒストンと結合してクロマチンを形成し、さらにクロマチンが核内アクチン繊維と相互作用してクロマチン高次構造を形成し、さらに核内空間に収納されている。したがって、ヒストンの核内アクチンの会合と解離のダイナミクスがゲノム機能制御に大きく関与しており、これを人為的に制御することによって、ゲノム機能を制御する新規手法の開発を行うことができる。本研究では、単離したクロマチンやアクチン水溶液、あるいは細胞にテラヘルツ光を照射することによって、細胞核内のアクチン繊維やクロマチンの状態を変化させ、それによってゲノム機能を制御することを目的とした。アクチン水溶液へのテラヘルツ光照射では、波長などの条件を変化させて照射を行い、アクチン繊維形成への影響を解析した。その結果、条件によってアクチン繊維形成に変化が観察された。また、培養細胞へのテラヘルツ光照射によって、アクチン繊維形成の促進が観察された。さらに、テラヘルツ光が細胞分裂影響を与えることも観察された。アクチン重合に影響を与える既存の化学物質との比較解析によって、このような効果がテラヘルツ光によるアクチン繊維の重合促進を介したものであることも示された。さらに、テラヘルツ光によるクロマチン機能への影響についても解析を行った。細胞へのテラヘルツ光照射により、いくつかの遺伝子の発現に変化が観察されたほか、DNA損傷修復への影響も観察されたことから、今後さらにこれらについての解析を行う予定である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

テラヘルツ光照射の条件を変えることで水溶液中のアクチン繊維形成への効果を解析できることが示された。さらに、培養細胞へのTHz光照射によってアクチン繊維形成における変化、ゲノム機能における変化が検出され、こちらについても詳細な解析に進行することが可能となった。一部、新型コロナ感染症の影響で予定してた測定ができなかった部分もあるが、以上より、本研究はおおむね順調に進展していると判断される。

今後の研究の推進方策

アクチン水溶液に対するテラヘルツ光照射の実験系が確立できたことから、今後はさらにこの実験系での解析を進めるほか、ヒストン水溶液を用いた解析も進める。さらに、細胞へのテラヘルツ光照射影響については、遺伝子発現変化の網羅的な解析なども計画してる。さらに、テラヘルツ光を照射した細胞の分化や遺伝子初期化についても解析を行うことにより、本技術の応用展開も図る。

次年度使用額が生じた理由

新型コロナウイルス感染症対策の目的で、研究分担者の施設への訪問が一部制限されたため、一部の実験を次年度に行うことになった。また、THz光照射により抗がん剤(DNA損傷試薬)の効果が変化するという、予想外の興味深い現象が観察され、その効果の再現性確認に時間をかけたため、一部の実験を次年度に行うことになった。次年度使用額については、一般試薬類、細胞培養試薬類、プラスチック器具類などの消耗品のために使用する計画である。

  • 研究成果

    (22件)

すべて 2021 2020 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 3件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (13件) (うち招待講演 1件)

  • [国際共同研究] Institute of Molecular Genetics(チェコ)

    • 国名
      チェコ
    • 外国機関名
      Institute of Molecular Genetics
  • [国際共同研究] Friedrich Miescher Institute(スイス)

    • 国名
      スイス
    • 外国機関名
      Friedrich Miescher Institute
  • [雑誌論文] Nucleoskeleton proteins for nuclear dynamics2021

    • 著者名/発表者名
      Miyamoto K, Harata M.
    • 雑誌名

      J Biochem.

      巻: 169 ページ: 237-241

    • DOI

      10.1093/jb/mvab006

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Modulating dynamics and function of nuclear actin with synthetic bicyclic peptides2021

    • 著者名/発表者名
      Machida N, Takahashi D, Ueno Y, Nakama Y, Gubeli RJ, Bertoldo D, Harata M.
    • 雑誌名

      J Biochem

      巻: 169 ページ: 295-302

    • DOI

      10.1093/jb/mvaa130

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] An improved functional analysis of linker-mediated complex (iFALC) strategy2020

    • 著者名/発表者名
      Nakabayashi Yu、Harata Masahiko、Seki Masayuki
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 526 ページ: 1164~1169

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2020.04.039

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Propagation of THz irradiation energy through aqueous layers: Demolition of actin filaments in living cells2020

    • 著者名/発表者名
      Yamazaki Shota、Harata Masahiko、Ueno Yuya、Tsubouchi Masaaki、Konagaya Keiji、Ogawa Yuichi、Isoyama Goro、Otani Chiko、Hoshina Hiromichi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 10 ページ: 9008

    • DOI

      10.1038/s41598-020-65955-5

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] SMARCA4 deficiency-associated heterochromatin induces intrinsic DNA replication stress and susceptibility to ATR inhibition in lung adenocarcinoma2020

    • 著者名/発表者名
      Kurashima Kiminori、Kashiwagi Hideto、Shimomura Iwao、Suzuki Ayako、Takeshita Fumitaka、Mazevet Marianne、Harata Masahiko、Yamashita Takayuki、Yamamoto Yusuke、Kohno Takashi、Shiotani Bunsyo
    • 雑誌名

      NAR Cancer

      巻: 2 ページ: zcaa005

    • DOI

      10.1093/narcan/zcaa005

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] The Actin-Family Protein Arp4 Is a Novel Suppressor for the Formation and Functions of Nuclear F-Actin2020

    • 著者名/発表者名
      Yamazaki Shota、Gerhold Christian、Yamamoto Koji、Ueno Yuya、Grosse Robert、Miyamoto Kei、Harata Masahiko
    • 雑誌名

      Cells

      巻: 9 ページ: 758~758

    • DOI

      10.3390/cells9030758

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Impairment of nuclear F-actin formation and its relevance to cellular phenotypes in Hutchinson-Gilford progeria syndrome2020

    • 著者名/発表者名
      Takahashi Yuto、Hiratsuka Shogo、Machida Nanako、Takahashi Daisuke、Matsushita Junpei、Hozak Pavel、Misteli Tom、Miyamoto Kei、Harata Masahiko
    • 雑誌名

      Nucleus

      巻: 11 ページ: 250~263

    • DOI

      10.1080/19491034.2020.1815395

    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] 核内アクチン繊維形成とゲノム機能制御におけるアクチンファミリーArp4の役割、The actin-family protein Arp4 suppresses formation of nuclear actin filament2021

    • 著者名/発表者名
      上野 佑也、山崎 祥他、GERHOLD Christian、山本 浩志、宮本 圭、原田 昌彦
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会
  • [学会発表] DNA損傷依存的な姉妹染色分体間接着への核膜孔の関与 Relocation of DNA breaks to nuclear pores is involved in damage-induced sister chromatid cohesion2021

    • 著者名/発表者名
      折原行希,高橋大輔,小西辰紀,尾間由佳子,島田健士, Susan M. Gasser, 原田昌彦, 堀籠智洋
    • 学会等名
      第38回染色体ワークショップ・第19回核ダイナミクス研究会
  • [学会発表] 細胞内のアクチン繊維形成はTHz光照射によって促進される2021

    • 著者名/発表者名
      細木 亮輔,山崎祥他,上野裕也,保科宏道,小川雄一,原田昌彦
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会
  • [学会発表] 東北大学農学研究科の取り組みと農学分野における利用可能性2021

    • 著者名/発表者名
      原田昌彦
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会、シンポジウム「農芸化学領域における次世代放射光施設利活用ポテンシャルと将来展望」
    • 招待講演
  • [学会発表] DNA損傷依存的な姉妹染色分体間接着への核膜孔の関与 Relocation of DNA breaks to nuclear pores is involved in damage-induced sister chromatid cohesion2021

    • 著者名/発表者名
      折原行希,高橋大輔,小西辰紀,尾間由佳子,島田健士, Susan M. Gasser, 原田昌彦, 堀籠智洋
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会
  • [学会発表] ヒストンバリアントH2A.Z導入機構と機能の進化的保存性解析2020

    • 著者名/発表者名
      北川紗帆、高橋大輔、日下部将之、尾間由佳子、奥裕之、成宮巧、中林悠、関政幸、原田昌彦
    • 学会等名
      酵母遺伝学フォーラム第 53 回研究報告会
  • [学会発表] THz wave irradiation activates polymerization of protein inside cells2020

    • 著者名/発表者名
      上野佑也、山崎祥他、細木亮輔、小川雄一、保科弘道、大谷知行、原田昌彦
    • 学会等名
      東北大学&理化学研究所 連携シンポジウム
  • [学会発表] アクチンファミリータンパク質Arp4は核内アクチン繊維の形成と機能を制御する、2020

    • 著者名/発表者名
      上野佑也 、山崎祥他 、Christian Gerhold 、山本浩志 、宮本圭 、原田昌彦
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
  • [学会発表] Evolutionary conservativeness of the histone variant H2A.Z in its deposition and functions2020

    • 著者名/発表者名
      北川紗帆 、日下部将之、奥裕之、高橋大輔、成宮巧、中林悠、関政幸、原田昌彦
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
  • [学会発表] 早老症細胞における核内アクチン繊維の形成異常と早老症病態との関連性2020

    • 著者名/発表者名
      高橋祐人、平塚晶吾、町田奈々子、Pavel Hozak、Tom Misteli、宮本圭、原田昌彦
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
  • [学会発表] ヒストンバリアントH2A.Zのゲノム導入部位決定機構解析2020

    • 著者名/発表者名
      高橋大輔、北川紗帆、小田有沙、仮屋園遼、尾間由佳子、太田邦史、原田昌彦
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
  • [学会発表] H2A.Zヒストンバリアントアイソフォーム間における酸化ストレス応答遺伝子EGR1転写制御機構の差異の解析 Distinctive roles of the histone variants H2A.Z.1 and H2A.Z.2 in the oxidative stress-induced transcription of EGR1"2020

    • 著者名/発表者名
      荻原望、高橋大輔、堀哲也、深川竜郎、原田昌彦
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
  • [学会発表] テラヘルツ光照射による細胞内アクチン重合化の促進2020

    • 著者名/発表者名
      細木亮輔、山崎祥他、上野佑也、保科宏道、小川雄一、原田昌彦
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会

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公開日: 2021-12-27  

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